More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02860 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_02860  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 316 aa  609  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.302767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6729  porphobilinogen deaminase  69.77 
 
 		 313 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1014  porphobilinogen deaminase  59.24 
 
 		 313 aa  342  2.9999999999999997e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0827893  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0668  porphobilinogen deaminase  62.71 
 
 		 318 aa  339  4e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10521  porphobilinogen deaminase  59.74 
 
 		 309 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0066  porphobilinogen deaminase  59.21 
 
 		 312 aa  331  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0447079  normal  0.735502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0845  porphobilinogen deaminase  59.87 
 
 		 312 aa  330  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.026448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4579  porphobilinogen deaminase  58.54 
 
 		 312 aa  326  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0677  porphobilinogen deaminase  57.23 
 
 		 314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0690  porphobilinogen deaminase  57.23 
 
 		 314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.118278 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0670  porphobilinogen deaminase  57.23 
 
 		 314 aa  319  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0357  porphobilinogen deaminase  55.56 
 
 		 322 aa  295  9e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0427  porphobilinogen deaminase  55.23 
 
 		 322 aa  294  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.751162  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0495  porphobilinogen deaminase  61.19 
 
 		 314 aa  294  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4439  porphobilinogen deaminase  54.55 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2732  porphobilinogen deaminase  52.53 
 
 		 320 aa  259  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6130  porphobilinogen deaminase  48.81 
 
 		 354 aa  259  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.401748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4371  porphobilinogen deaminase  50.32 
 
 		 335 aa  255  8e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24400  hydroxymethylbilane synthase  53.96 
 
 		 358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0262  porphobilinogen deaminase  52.26 
 
 		 303 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.207863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0486  porphobilinogen deaminase  45.95 
 
 		 395 aa  249  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.471298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1544  porphobilinogen deaminase  55.69 
 
 		 305 aa  246  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.471062  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8325  porphobilinogen deaminase  50.32 
 
 		 317 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0549  Hydroxymethylbilane synthase  48.72 
 
 		 306 aa  235  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  0.484278 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0618  porphobilinogen deaminase  51.61 
 
 		 326 aa  230  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0490105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0237  hydroxymethylbilane synthase  47.59 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26790  hydroxymethylbilane synthase  53.36 
 
 		 337 aa  225  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4012  porphobilinogen deaminase  53.88 
 
 		 334 aa  222  4.9999999999999996e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  normal  0.94998 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3252  porphobilinogen deaminase  53.58 
 
 		 343 aa  222  7e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0180697  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  44.48 
 
 		 311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36050  hydroxymethylbilane synthase  47.3 
 
 		 312 aa  220  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000727024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  42.44 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3437  porphobilinogen deaminase  50.18 
 
 		 342 aa  217  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000351099  decreased coverage  0.00118997 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2489  porphobilinogen deaminase  46.91 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100869 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2492  porphobilinogen deaminase  49.81 
 
 		 344 aa  214  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0471431  normal  0.22632 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  42.3 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2767  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 332 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15190  porphobilinogen deaminase  48.91 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.229707  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  40.06 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  43.95 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0093  porphobilinogen deaminase  43.17 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  40.38 
 
 		 306 aa  202  6e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  42.44 
 
 		 313 aa  202  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  39.62 
 
 		 314 aa  201  9e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  41.46 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0893  porphobilinogen deaminase  40.45 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  41.82 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  40.13 
 
 		 313 aa  200  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  41.16 
 
 		 309 aa  200  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  44.09 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  40.5 
 
 		 321 aa  199  5e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  40.26 
 
 		 318 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1515  porphobilinogen deaminase  40.06 
 
 		 313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  41.8 
 
 		 309 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  42.4 
 
 		 310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  41.69 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  41.8 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  41.58 
 
 		 318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0011  porphobilinogen deaminase  38.29 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1887  porphobilinogen deaminase  41.32 
 
 		 314 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  42.44 
 
 		 316 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2170  porphobilinogen deaminase  38.29 
 
 		 307 aa  196  6e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160302  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  42.12 
 
 		 310 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  40.13 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04137  porphobilinogen deaminase  44.73 
 
 		 304 aa  195  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.870517  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1796  porphobilinogen deaminase  38.85 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.160972  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0950  porphobilinogen deaminase  43.2 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  41.35 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  40.84 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  43.73 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1815  porphobilinogen deaminase  40.77 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  40.32 
 
 		 318 aa  192  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  41.35 
 
 		 314 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0701  porphobilinogen deaminase  36.39 
 
 		 298 aa  192  7e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.141584  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  40.91 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  41.08 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  45.93 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0354  porphobilinogen deaminase  41.43 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  40.45 
 
 		 310 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  40.45 
 
 		 310 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  40.45 
 
 		 310 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  40.45 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  42.04 
 
 		 313 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0318  porphobilinogen deaminase  41.92 
 
 		 299 aa  189  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  41.03 
 
 		 314 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  41.03 
 
 		 314 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  38.97 
 
 		 285 aa  189  5.999999999999999e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3530  porphobilinogen deaminase  43.13 
 
 		 303 aa  188  9e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0975  porphobilinogen deaminase  43.31 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  40.39 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  38.34 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1398  porphobilinogen deaminase  46.64 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  40.51 
 
 		 310 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  40.51 
 
 		 310 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  39.56 
 
 		 320 aa  187  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  40.13 
 
 		 310 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  40.26 
 
 		 310 aa  186  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1225  porphobilinogen deaminase  42.31 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1226  porphobilinogen deaminase  40.96 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000455197  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  40.32 
 
 		 312 aa  186  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>