More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1398 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1398  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 300 aa  590  1e-168  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2984  porphobilinogen deaminase  65.54 
 
 		 304 aa  354  7.999999999999999e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.896426 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3450  porphobilinogen deaminase  46.85 
 
 		 526 aa  239  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.78794 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  44.53 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  46.27 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  46.1 
 
 		 310 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  46.82 
 
 		 315 aa  209  5e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  46.1 
 
 		 310 aa  208  8e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  46.1 
 
 		 310 aa  208  8e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  46.1 
 
 		 310 aa  208  8e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  45.72 
 
 		 310 aa  208  9e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  45.15 
 
 		 309 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  44.94 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24400  hydroxymethylbilane synthase  47.17 
 
 		 358 aa  206  3e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  46.64 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  45.72 
 
 		 310 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  45.72 
 
 		 310 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  45.72 
 
 		 310 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  45.72 
 
 		 310 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  43.45 
 
 		 318 aa  205  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  45.55 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  45.52 
 
 		 326 aa  205  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  44.57 
 
 		 317 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  44.36 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  44.57 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  44.78 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  48.21 
 
 		 310 aa  202  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  46.88 
 
 		 313 aa  202  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  48.02 
 
 		 317 aa  202  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2263  porphobilinogen deaminase  46.64 
 
 		 339 aa  202  8e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  43.66 
 
 		 310 aa  202  8e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  44.41 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  46.62 
 
 		 322 aa  198  7e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  45.74 
 
 		 317 aa  198  9e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  46.3 
 
 		 313 aa  198  9e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5131  porphobilinogen deaminase  42.15 
 
 		 322 aa  197  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  41.29 
 
 		 318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  45.69 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  47.24 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  47.24 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  47.24 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  47.24 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  47.24 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  45.06 
 
 		 321 aa  196  3e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  45.28 
 
 		 326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  42.26 
 
 		 318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  45.69 
 
 		 313 aa  196  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  44.36 
 
 		 309 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  43.53 
 
 		 311 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  45.32 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  44.36 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  43.09 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  43.92 
 
 		 309 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1014  porphobilinogen deaminase  46.25 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0827893  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  45.32 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  45.32 
 
 		 313 aa  192  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  40.89 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  44.74 
 
 		 303 aa  192  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  43.92 
 
 		 309 aa  192  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  43.92 
 
 		 309 aa  192  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  43.53 
 
 		 309 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  43.53 
 
 		 309 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  43.92 
 
 		 309 aa  192  8e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  43.53 
 
 		 309 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  43.53 
 
 		 309 aa  191  9e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  43.53 
 
 		 309 aa  191  9e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  44.94 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  45.53 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  41.76 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  44.75 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1322  porphobilinogen deaminase  41.26 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000625497  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  41.29 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  44.94 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  41.29 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  39.25 
 
 		 313 aa  190  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  46.69 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  44.53 
 
 		 320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0186  porphobilinogen deaminase  45.63 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  44.53 
 
 		 320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  43.36 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  44.53 
 
 		 320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  45.78 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  42.48 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  44.53 
 
 		 318 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  44.53 
 
 		 313 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  44.53 
 
 		 313 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  44.57 
 
 		 313 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0525  porphobilinogen deaminase  45.49 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  44.53 
 
 		 320 aa  189  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  44.53 
 
 		 320 aa  189  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  44.79 
 
 		 314 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2791  porphobilinogen deaminase  41.83 
 
 		 309 aa  189  7e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  45.45 
 
 		 311 aa  189  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0208  porphobilinogen deaminase  45.24 
 
 		 313 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  41.51 
 
 		 313 aa  187  1e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2007  porphobilinogen deaminase  44 
 
 		 320 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2032  porphobilinogen deaminase  44 
 
 		 320 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0950  porphobilinogen deaminase  38.43 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0496  porphobilinogen deaminase  38.14 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  42.66 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>