More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3450 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3450  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 526 aa  1070    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.78794 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1398  porphobilinogen deaminase  46.85 
 
 		 300 aa  239  8e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  47.78 
 
 		 311 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  44.29 
 
 		 310 aa  228  3e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2984  porphobilinogen deaminase  42.75 
 
 		 304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.896426 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  48.62 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  45.59 
 
 		 309 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  47.83 
 
 		 309 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  49.8 
 
 		 310 aa  216  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  49.02 
 
 		 315 aa  216  7e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  47.83 
 
 		 309 aa  216  8e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  47.83 
 
 		 309 aa  216  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  47.83 
 
 		 309 aa  216  9e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  47.83 
 
 		 309 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  47.43 
 
 		 309 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  47.43 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  47.24 
 
 		 309 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  47.43 
 
 		 309 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  46.21 
 
 		 306 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  49.21 
 
 		 313 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  47.6 
 
 		 285 aa  210  5e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  46.22 
 
 		 314 aa  210  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  45.45 
 
 		 317 aa  210  6e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  44.78 
 
 		 311 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  45.56 
 
 		 309 aa  208  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  47.22 
 
 		 312 aa  206  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  43.59 
 
 		 316 aa  206  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  46.15 
 
 		 313 aa  206  9e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  46.88 
 
 		 318 aa  205  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1048  porphobilinogen deaminase  46.09 
 
 		 309 aa  206  1e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0191591  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  42.86 
 
 		 308 aa  205  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  45.7 
 
 		 311 aa  206  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  43.61 
 
 		 310 aa  202  9e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  44.49 
 
 		 318 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1324  porphobilinogen deaminase  46.85 
 
 		 342 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  44.66 
 
 		 318 aa  201  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0649  porphobilinogen deaminase  46.4 
 
 		 307 aa  201  3e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.485602  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0570  porphobilinogen deaminase  46.4 
 
 		 307 aa  201  3e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  40.4 
 
 		 310 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12370  porphobilinogen deaminase  42.69 
 
 		 313 aa  200  5e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  45.42 
 
 		 308 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0767  porphobilinogen deaminase  43.3 
 
 		 308 aa  199  9e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1515  porphobilinogen deaminase  43.89 
 
 		 313 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  45.42 
 
 		 308 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  44.88 
 
 		 318 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  45.97 
 
 		 311 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1385  porphobilinogen deaminase  46 
 
 		 307 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0691  porphobilinogen deaminase  44.53 
 
 		 303 aa  197  3e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.411778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0950  porphobilinogen deaminase  44.19 
 
 		 313 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1322  porphobilinogen deaminase  44.84 
 
 		 314 aa  197  5.000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000625497  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  42.16 
 
 		 315 aa  197  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  44.09 
 
 		 309 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  42.96 
 
 		 313 aa  196  7e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  45.16 
 
 		 312 aa  196  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  41.11 
 
 		 313 aa  196  9e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0767  porphobilinogen deaminase  42.97 
 
 		 311 aa  196  1e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  45.08 
 
 		 318 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0525  porphobilinogen deaminase  45.49 
 
 		 311 aa  195  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  45.08 
 
 		 320 aa  195  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  42.63 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  45.08 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  45.08 
 
 		 320 aa  195  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  45.08 
 
 		 320 aa  195  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  44.62 
 
 		 326 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  42.2 
 
 		 314 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  44.27 
 
 		 313 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  45.08 
 
 		 320 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  45.08 
 
 		 313 aa  194  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  45.08 
 
 		 313 aa  194  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  44.09 
 
 		 318 aa  194  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24400  hydroxymethylbilane synthase  41.86 
 
 		 358 aa  193  6e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  45.28 
 
 		 313 aa  193  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1715  porphobilinogen deaminase  45.1 
 
 		 315 aa  193  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  43.02 
 
 		 313 aa  192  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  45.04 
 
 		 313 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  45.04 
 
 		 318 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  45.04 
 
 		 313 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  44.7 
 
 		 320 aa  192  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  45.04 
 
 		 320 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  45.04 
 
 		 320 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  44.18 
 
 		 317 aa  192  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  45.1 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  44.44 
 
 		 310 aa  192  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  41.67 
 
 		 311 aa  192  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  45.42 
 
 		 312 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  43.95 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  39.85 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  43.41 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  45.24 
 
 		 309 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  43.95 
 
 		 312 aa  190  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0048  porphobilinogen deaminase  45.2 
 
 		 304 aa  190  5e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1702  porphobilinogen deaminase  41.09 
 
 		 305 aa  190  5.999999999999999e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1796  porphobilinogen deaminase  41.6 
 
 		 313 aa  190  5.999999999999999e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.160972  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  45.28 
 
 		 326 aa  190  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  44.88 
 
 		 310 aa  189  8e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1234  porphobilinogen deaminase  41.06 
 
 		 308 aa  189  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0387484  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  44.31 
 
 		 313 aa  189  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2232  porphobilinogen deaminase  45.42 
 
 		 312 aa  188  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495959  normal  0.0113482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  42.21 
 
 		 313 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1732  porphobilinogen deaminase  43.8 
 
 		 318 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0335479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>