More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0237 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  100 
 
 
218 aa  432  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  68.82 
 
 
193 aa  251  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  67.57 
 
 
240 aa  241  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  56.99 
 
 
193 aa  207  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  53.96 
 
 
250 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  54.38 
 
 
267 aa  201  7e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0197  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  51.24 
 
 
264 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  58.79 
 
 
298 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  51.21 
 
 
271 aa  185  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  54.59 
 
 
217 aa  185  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  60.14 
 
 
222 aa  182  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  61.59 
 
 
299 aa  182  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  60.56 
 
 
265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0232  GrpE protein  53.23 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.283245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  43.41 
 
 
235 aa  165  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  42.03 
 
 
217 aa  150  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0441  GrpE protein  46.35 
 
 
209 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  42.92 
 
 
215 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  42.92 
 
 
215 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  42.45 
 
 
215 aa  148  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  42.86 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  46.82 
 
 
261 aa  144  8.000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  44.66 
 
 
222 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  40.91 
 
 
205 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  51.49 
 
 
212 aa  143  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  41.62 
 
 
228 aa  142  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3708  GrpE protein  40.82 
 
 
206 aa  137  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.500996 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  41.33 
 
 
235 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0350  GrpE protein  50 
 
 
199 aa  135  7.000000000000001e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.851943 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  38.57 
 
 
224 aa  132  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  44.09 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  47.66 
 
 
188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5217  GrpE protein  43.06 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  37.13 
 
 
232 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05500  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  43.87 
 
 
208 aa  121  8e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  46.15 
 
 
199 aa  121  9e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  37.44 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18800  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  37.79 
 
 
220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00738423  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  33.14 
 
 
226 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  40.41 
 
 
213 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  38.06 
 
 
223 aa  99.8  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  37.42 
 
 
203 aa  99.4  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  35.84 
 
 
207 aa  99  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  34.76 
 
 
248 aa  98.2  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  36.91 
 
 
246 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  37.32 
 
 
242 aa  95.5  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.71 
 
 
243 aa  93.2  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  34.27 
 
 
260 aa  92.8  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  37.66 
 
 
218 aa  92  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  38.76 
 
 
194 aa  91.7  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  37.14 
 
 
181 aa  91.3  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  34.08 
 
 
247 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  33.55 
 
 
181 aa  91.3  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  36.43 
 
 
189 aa  89.7  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  34.72 
 
 
200 aa  89.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  32.58 
 
 
190 aa  89.4  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  33.33 
 
 
197 aa  89  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  37.41 
 
 
207 aa  88.6  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  34.2 
 
 
201 aa  88.6  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  31.17 
 
 
282 aa  88.2  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  39.53 
 
 
194 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  35.36 
 
 
202 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  34.62 
 
 
222 aa  87.8  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  33.51 
 
 
237 aa  87.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  35.29 
 
 
286 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  36.92 
 
 
261 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  36.92 
 
 
261 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  36.31 
 
 
210 aa  85.9  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  34.81 
 
 
202 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  33.78 
 
 
225 aa  85.5  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3590  GrpE protein  35.71 
 
 
177 aa  85.5  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00352283  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  32.72 
 
 
207 aa  84.7  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  33.14 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  33.14 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  35.17 
 
 
172 aa  84  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  34.34 
 
 
238 aa  84  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0674  grpE protein  30.99 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.04297  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  33.77 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  35.06 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4023  GrpE protein  36.42 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0596565  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  32.79 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  31.1 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  34.52 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  35.17 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  33.81 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  28.71 
 
 
259 aa  82  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  34.01 
 
 
189 aa  82  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  35.1 
 
 
202 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  28.03 
 
 
225 aa  81.6  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  37.68 
 
 
198 aa  82  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0427  GrpE protein  34.57 
 
 
191 aa  82  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0102412 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  33.72 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  28.95 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  33.72 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2165  GrpE protein  35.25 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.281053  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  33.72 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  28.41 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  28.41 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  30.97 
 
 
186 aa  80.9  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  31.76 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>