More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0232 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0232  GrpE protein  100 
 
 		 278 aa  541  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.283245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  56.49 
 
 		 271 aa  255  6e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  52.94 
 
 		 218 aa  199  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  54.27 
 
 		 193 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  48.95 
 
 		 240 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  48.42 
 
 		 217 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  47.89 
 
 		 193 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  43.52 
 
 		 267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  53.28 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  43.07 
 
 		 235 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  43.9 
 
 		 214 aa  149  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  50 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  41.89 
 
 		 222 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  48.08 
 
 		 265 aa  143  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  51.45 
 
 		 299 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  40.28 
 
 		 250 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  43.07 
 
 		 228 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0197  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  42.05 
 
 		 264 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135076  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  45.05 
 
 		 235 aa  136  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  43.01 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18800  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  45.93 
 
 		 220 aa  131  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00738423  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  44.97 
 
 		 209 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0441  GrpE protein  40.78 
 
 		 209 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  41.75 
 
 		 215 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  41.75 
 
 		 215 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  41.67 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  50 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  39.49 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3708  GrpE protein  40.5 
 
 		 206 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.500996 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  45.41 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  38.69 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  47.9 
 
 		 188 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  43.41 
 
 		 232 aa  115  7.999999999999999e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0350  GrpE protein  50.89 
 
 		 199 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.851943 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5217  GrpE protein  42.34 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05500  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  41.21 
 
 		 208 aa  106  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  36.14 
 
 		 226 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  41.79 
 
 		 199 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  29.65 
 
 		 191 aa  86.3  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  32.52 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  35.19 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  31.17 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  30.21 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  34.64 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  32.81 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  34.04 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  31.55 
 
 		 286 aa  82  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  37.14 
 
 		 172 aa  81.3  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  37.14 
 
 		 172 aa  81.6  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  32.89 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  30.73 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  32.3 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  32.3 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  30.71 
 
 		 195 aa  78.2  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.43 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  31.13 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00660  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  34.62 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.204562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  33.33 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  30.14 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  30.82 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  34.38 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  34.01 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  34.01 
 
 		 208 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  32.04 
 
 		 189 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  29.01 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  33.59 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  33.59 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  32.8 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  35.56 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  31.1 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0648  GrpE protein  34.29 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  32.09 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  34.21 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  34.93 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  34.48 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1961  GrpE protein  38.76 
 
 		 205 aa  71.6  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.388028  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  37.8 
 
 		 192 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  34.39 
 
 		 194 aa  71.6  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  32.31 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  33.08 
 
 		 181 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  32.5 
 
 		 201 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  33.77 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  33.33 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  30 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  29.93 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  30.34 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  34.78 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  31.48 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  31.08 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  30.73 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  32.95 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1605  GrpE protein  33.58 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0303276  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  30.92 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  30.52 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  31.34 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  29.93 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  30.41 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  28.75 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  32.9 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>