More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4353 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  100 
 
 		 271 aa  530  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0232  GrpE protein  56.49 
 
 		 278 aa  249  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.283245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  51.21 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  54.12 
 
 		 193 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  50.55 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  52.6 
 
 		 217 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  44.98 
 
 		 235 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  57.45 
 
 		 267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  53.4 
 
 		 193 aa  165  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0197  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  50.87 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135076  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  55.8 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  55.8 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  50.63 
 
 		 298 aa  155  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  53.28 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  44.95 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  48.82 
 
 		 261 aa  142  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  41.59 
 
 		 214 aa  139  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  43.08 
 
 		 235 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  42.65 
 
 		 205 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  41.89 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  44.44 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  43.27 
 
 		 215 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  43.27 
 
 		 215 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  43.27 
 
 		 215 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  40.34 
 
 		 209 aa  135  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18800  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  45.28 
 
 		 220 aa  135  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00738423  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  40.64 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5217  GrpE protein  44.95 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  49.25 
 
 		 212 aa  126  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  47.76 
 
 		 199 aa  118  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0441  GrpE protein  37.56 
 
 		 209 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3708  GrpE protein  40.2 
 
 		 206 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.500996 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  37.25 
 
 		 217 aa  112  8.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  34.05 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0350  GrpE protein  47.75 
 
 		 199 aa  110  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.851943 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  46.49 
 
 		 188 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  35.97 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05500  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  43.7 
 
 		 208 aa  95.9  7e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  37.57 
 
 		 207 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  37.89 
 
 		 194 aa  89.7  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  35.19 
 
 		 210 aa  88.6  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  33.77 
 
 		 226 aa  88.6  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  35.95 
 
 		 172 aa  87.4  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  35.95 
 
 		 172 aa  87.8  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  36.84 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  31.82 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  29.25 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  36.14 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  28.4 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  35.1 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  33.59 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  31.58 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  31.37 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  32.12 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  30.53 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  37.01 
 
 		 192 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  34.01 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  28.57 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1961  GrpE protein  36.3 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.388028  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  26.67 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  34.62 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  33.85 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  33.85 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  33.1 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  29.45 
 
 		 224 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  26.71 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  32.92 
 
 		 180 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  34.22 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  31.51 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  31.51 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  31.51 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  31.51 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  36.96 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0309  GrpE protein  33.74 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  31.51 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  34.71 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  28.3 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  32.31 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  28.3 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  31.51 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  32.31 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  32.19 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  31.51 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  34.06 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  32.31 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  31.49 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00660  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  34.62 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.204562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  31.51 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  30.87 
 
 		 181 aa  72  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  33.08 
 
 		 210 aa  72  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  31.51 
 
 		 198 aa  72  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  32.31 
 
 		 200 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  32.19 
 
 		 192 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  32.45 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  31.53 
 
 		 201 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  30.22 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  33.11 
 
 		 204 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  32.45 
 
 		 230 aa  72  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>