More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3708 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3708  GrpE protein  100 
 
 		 206 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.500996 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0441  GrpE protein  49.5 
 
 		 209 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  49.76 
 
 		 217 aa  151  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  45.45 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  40.82 
 
 		 218 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  41.63 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  43.63 
 
 		 240 aa  132  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  39.22 
 
 		 193 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0350  GrpE protein  51.57 
 
 		 199 aa  118  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.851943 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  52.32 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  38.1 
 
 		 250 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  38.46 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  41.22 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  38.43 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  40.27 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0232  GrpE protein  40.5 
 
 		 278 aa  108  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.283245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  43.37 
 
 		 265 aa  105  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  41.41 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  36.53 
 
 		 235 aa  105  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05500  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  47.06 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0197  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  42.13 
 
 		 264 aa  105  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135076  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  38.03 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  42.38 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  39 
 
 		 205 aa  101  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  40.2 
 
 		 271 aa  99.4  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  37.04 
 
 		 217 aa  97.1  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  38.67 
 
 		 222 aa  96.7  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  39 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  39 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  39 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  35.64 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  43.8 
 
 		 298 aa  95.1  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  34.18 
 
 		 235 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  38.89 
 
 		 261 aa  91.3  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18800  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  39.09 
 
 		 220 aa  88.6  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00738423  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5217  GrpE protein  35.65 
 
 		 232 aa  88.2  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  37.67 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  37.5 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  31.33 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4434  GrpE protein  37.58 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  32.72 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  30.64 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  32.37 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  32.18 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  31.29 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  34.93 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  31.16 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  33.96 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  34.64 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  32.88 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  30.41 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  34.57 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  29.22 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  32.74 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  32.24 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  33.71 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  33.79 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  32.54 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  36.72 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  30.11 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  32.26 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  33.54 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  28.73 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  34.23 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  34.25 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0427  GrpE protein  33.55 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0102412 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1259  heat shock protein GrpE  30.63 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.481119  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  31.05 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  27.47 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  34.62 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  34.01 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  36.73 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  33.54 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  31.33 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  31.94 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  28.9 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  29.69 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  32.62 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  31.45 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  29.17 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  29.17 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  32.45 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  37.09 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  30.43 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  32.88 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  37.09 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  37.09 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  37.09 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  37.09 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  34.72 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  37.09 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  37.09 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  37.09 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  33.66 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  33.11 
 
 		 218 aa  62  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  31.79 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  33.33 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  35.83 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>