More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0337 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  100 
 
 		 201 aa  407  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  76.65 
 
 		 187 aa  266  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.84 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  50.75 
 
 		 208 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.95 
 
 		 207 aa  204  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.82 
 
 		 217 aa  203  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  56.98 
 
 		 226 aa  201  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  63.01 
 
 		 202 aa  201  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  51.47 
 
 		 204 aa  200  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  57.06 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  55.62 
 
 		 210 aa  195  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  54.35 
 
 		 206 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  53.09 
 
 		 207 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.27 
 
 		 202 aa  193  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  60.27 
 
 		 202 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  57.96 
 
 		 222 aa  192  2e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  58.71 
 
 		 206 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  53.89 
 
 		 222 aa  190  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  56.49 
 
 		 228 aa  189  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  60 
 
 		 206 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  55.56 
 
 		 230 aa  184  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  55.56 
 
 		 230 aa  184  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  50.55 
 
 		 205 aa  184  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  51.72 
 
 		 203 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  50.53 
 
 		 197 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  43.71 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  41.88 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  43.43 
 
 		 181 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  45.39 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  42.58 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  41.3 
 
 		 210 aa  126  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3643  GrpE protein  41.18 
 
 		 221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  37.89 
 
 		 179 aa  123  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15032  predicted protein  42.21 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189878  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14947  mitochondrial GrpE-like protein  38.38 
 
 		 240 aa  122  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0088904  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  41.45 
 
 		 186 aa  122  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  42.36 
 
 		 181 aa  122  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  41.45 
 
 		 189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  40.76 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  39.1 
 
 		 197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  41.45 
 
 		 186 aa  118  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64096  predicted protein  39.46 
 
 		 188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  0.0799005 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0208  GrpE protein  37.25 
 
 		 188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1974  GrpE protein  38.55 
 
 		 210 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.26677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  39.16 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  41.38 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  38.89 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  38.89 
 
 		 203 aa  111  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  38.19 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  38.19 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  38.19 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  38.19 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  38.19 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  38.19 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  38.19 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  39.52 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  38.03 
 
 		 200 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  40.56 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 201 aa  108  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  41.67 
 
 		 200 aa  107  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  37.11 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  41.26 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  37.76 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_002978  WD0800  heat shock protein GrpE  39.22 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.200393  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  37.06 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  38.3 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  38.26 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  33.89 
 
 		 187 aa  104  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  34.2 
 
 		 193 aa  104  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  31.98 
 
 		 210 aa  104  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  41.61 
 
 		 175 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  37.32 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  37.87 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1647  GrpE protein  35.88 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.165316  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  38.73 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  38.16 
 
 		 173 aa  101  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  35 
 
 		 186 aa  101  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1259  heat shock protein GrpE  41.61 
 
 		 176 aa  101  9e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.481119  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  39.44 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  36.21 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  41.55 
 
 		 176 aa  99.8  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  42.76 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0111  GrpE protein  29.87 
 
 		 199 aa  99.8  3e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  36.81 
 
 		 198 aa  99  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  37.78 
 
 		 203 aa  99.4  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  35.8 
 
 		 189 aa  99  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  36.71 
 
 		 260 aa  97.8  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  38.03 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  33.73 
 
 		 187 aa  97.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  39.22 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  33.99 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  39.16 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  40.13 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  34.91 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  38.61 
 
 		 189 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  38.89 
 
 		 178 aa  96.3  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  35.9 
 
 		 282 aa  95.9  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>