More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3807 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  100 
 
 		 228 aa  455  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  79.31 
 
 		 222 aa  354  6.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18800  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  49.75 
 
 		 220 aa  177  9e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00738423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  45.93 
 
 		 193 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  45.05 
 
 		 250 aa  154  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  46.31 
 
 		 193 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  41.62 
 
 		 218 aa  142  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  44.16 
 
 		 240 aa  141  9e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0197  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  43.81 
 
 		 264 aa  136  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135076  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  44.39 
 
 		 215 aa  134  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  44.39 
 
 		 215 aa  134  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  44.39 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  52.59 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  52.48 
 
 		 222 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  48.05 
 
 		 265 aa  132  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  40.91 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  43.46 
 
 		 209 aa  128  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  46.07 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  41.89 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  36.75 
 
 		 267 aa  119  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  38.14 
 
 		 235 aa  118  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  36.23 
 
 		 235 aa  118  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  49.59 
 
 		 298 aa  118  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  39.38 
 
 		 205 aa  118  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  36.59 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05500  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  50.4 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  38.03 
 
 		 217 aa  115  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  38.3 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0232  GrpE protein  43.07 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.283245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  46.67 
 
 		 212 aa  112  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0350  GrpE protein  51.3 
 
 		 199 aa  112  7.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.851943 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0441  GrpE protein  39.09 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  47.58 
 
 		 188 aa  106  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3708  GrpE protein  38.03 
 
 		 206 aa  105  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.500996 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  44.03 
 
 		 199 aa  99  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5217  GrpE protein  41.95 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  34.62 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  40 
 
 		 207 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  36.43 
 
 		 201 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  40 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  34.81 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  38.41 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  39.13 
 
 		 172 aa  81.3  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0853  GrpE protein  37.16 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000644749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  34.73 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  30.65 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  30.39 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  35.97 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3590  GrpE protein  34.97 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00352283  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  39.13 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  37.41 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  36.31 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  38.13 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  36.03 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  34.31 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  34.72 
 
 		 189 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  34.81 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1423  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)-like  30.65 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  33.8 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  32.73 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  35.92 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  32.64 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  34.07 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  34.07 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  34.07 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  34.07 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  34.81 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  29.05 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  36.05 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  34.07 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  35.38 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  35.38 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  35.1 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  34.07 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  34.07 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  34.07 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  34.07 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  34.07 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  35.21 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  34.07 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  34.78 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  36.81 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  33.33 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  36.62 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  34.07 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  34.07 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  29.83 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  32.59 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  33.33 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  34.07 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  32.12 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  36.43 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  36.43 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  32.62 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  37.59 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  34.03 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  33.54 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  33.14 
 
 		 204 aa  72  0.000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  32.37 
 
 		 242 aa  72  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>