More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1025 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  100 
 
 		 194 aa  388  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  56.15 
 
 		 201 aa  203  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2165  GrpE protein  62.34 
 
 		 191 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.281053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  52.53 
 
 		 195 aa  181  6e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  48.96 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  49.23 
 
 		 181 aa  141  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  46.62 
 
 		 189 aa  128  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  41.71 
 
 		 199 aa  124  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  48.87 
 
 		 199 aa  124  7e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  40.77 
 
 		 208 aa  121  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  40.77 
 
 		 208 aa  121  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  45.59 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  41.57 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  45.59 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  39.64 
 
 		 194 aa  115  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  43.61 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  43.61 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  43.38 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  44.03 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  42.31 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  40.69 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 198 aa  111  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  40.74 
 
 		 212 aa  111  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  39.01 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  39.77 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  41.88 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  36.65 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  39.01 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  39.01 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  42.22 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  40.3 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  42.94 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  36.26 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  40.77 
 
 		 189 aa  108  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  41.43 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  41.43 
 
 		 203 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  40.43 
 
 		 198 aa  107  9.000000000000001e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  41.04 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  44.29 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  40.58 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  35.71 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  44.52 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  36.92 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  40.74 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  39.26 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  41.18 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  40.3 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  41.73 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  41.38 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  40.31 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  40.44 
 
 		 187 aa  104  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  40.71 
 
 		 203 aa  104  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  37.59 
 
 		 187 aa  104  8e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  40.44 
 
 		 189 aa  104  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  39.53 
 
 		 187 aa  104  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  39.88 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  43.51 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  32.79 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  40.44 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  39.53 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  32.79 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  32.79 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  42.95 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  41.04 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  35.53 
 
 		 198 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  39.55 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  43.08 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  39.86 
 
 		 197 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  40.3 
 
 		 200 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  41.98 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  32.79 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  32.79 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  32.79 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  32.79 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  32.79 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  43.7 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  34.21 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  34.83 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  40.43 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  39.1 
 
 		 176 aa  102  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  40.43 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  40.43 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  40.43 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  40.43 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  34.21 
 
 		 192 aa  101  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  40.3 
 
 		 179 aa  101  5e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  39.55 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  40.88 
 
 		 189 aa  101  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  37.31 
 
 		 241 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 199 aa  101  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  37.31 
 
 		 250 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  37.08 
 
 		 195 aa  100  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  38.52 
 
 		 194 aa  100  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  39.26 
 
 		 209 aa  100  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1513  heat shock protein GrpE  44.62 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  37.31 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  38.35 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1456  heat shock protein GrpE  44.62 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.022256  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  37.31 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>