More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1381 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  100 
 
 		 208 aa  429  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  99.02 
 
 		 204 aa  412  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  43.22 
 
 		 199 aa  136  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  46.05 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  46.47 
 
 		 199 aa  132  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  40 
 
 		 210 aa  125  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  39.31 
 
 		 210 aa  124  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  38.06 
 
 		 189 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  39.74 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  40.79 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  42.45 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  39.58 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  39.22 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  38.93 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  37.25 
 
 		 187 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  37.42 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  38.89 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  37.25 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  40.13 
 
 		 200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  37.82 
 
 		 185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  35.71 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  37.25 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  39.47 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  43.61 
 
 		 194 aa  112  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  42.66 
 
 		 200 aa  112  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  37.58 
 
 		 184 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  41.89 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  40 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  41.06 
 
 		 179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  39.55 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  35.15 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  37.31 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  38.16 
 
 		 211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  39.85 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  40.91 
 
 		 178 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  40.65 
 
 		 209 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  40.3 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  38.04 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  40.26 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  42.21 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  38.81 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  39.47 
 
 		 194 aa  106  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  38.56 
 
 		 190 aa  106  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  40.91 
 
 		 178 aa  106  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  39.35 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0916  co-chaperone GrpE  39.22 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.764305  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  36.81 
 
 		 186 aa  105  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  36.91 
 
 		 187 aa  105  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  35.78 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  37.25 
 
 		 240 aa  104  9e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  35.78 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  35.78 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  38 
 
 		 186 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  35.78 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  35.78 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  39.72 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  35.78 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  36 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  35.78 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  35.78 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.91 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  35.78 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  34.15 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  40 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  38.06 
 
 		 200 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  42.48 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  40 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  40.71 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  41.01 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  39.61 
 
 		 181 aa  101  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  39.71 
 
 		 204 aa  102  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 		 197 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  40 
 
 		 217 aa  102  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  42.54 
 
 		 195 aa  101  7e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  37.58 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  35.33 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  38.71 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  37.33 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  33.88 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  33.01 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  38.16 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  39.35 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1970  GrpE protein  38.64 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000003831  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  33.01 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  36.48 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  38.78 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  39.16 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  39.35 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  39.35 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  38.06 
 
 		 190 aa  99.8  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  39.35 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  39.35 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  38.06 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  41.43 
 
 		 198 aa  99.8  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  37.58 
 
 		 171 aa  99  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  34.07 
 
 		 192 aa  99.4  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  34.07 
 
 		 192 aa  99.4  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  33.82 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>