More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0150 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  100 
 
 
179 aa  365  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  77.22 
 
 
180 aa  288  4e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  50 
 
 
186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  54.14 
 
 
175 aa  168  4e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1090  co-chaperone GrpE  51.2 
 
 
173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000331967  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  50.56 
 
 
176 aa  159  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1259  heat shock protein GrpE  49.44 
 
 
176 aa  154  7e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.481119  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1120  co-chaperone GrpE  55.56 
 
 
194 aa  150  7e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0675757  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0936  heat shock protein GrpE  48.09 
 
 
169 aa  149  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0941203  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1643  GrpE protein  48.63 
 
 
185 aa  141  6e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  42.54 
 
 
198 aa  119  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  40 
 
 
185 aa  115  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  38.06 
 
 
185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.87 
 
 
217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  40.45 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  39.11 
 
 
189 aa  114  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  37.42 
 
 
185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  37.91 
 
 
184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  40.88 
 
 
182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  37.91 
 
 
184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  41.22 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  34.97 
 
 
189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  41.33 
 
 
210 aa  112  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  43.87 
 
 
212 aa  111  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  37.08 
 
 
190 aa  111  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  35.91 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  37.7 
 
 
226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  41.18 
 
 
228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  36.24 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 
208 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 
208 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  43.04 
 
 
194 aa  109  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  43.45 
 
 
217 aa  108  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  36.61 
 
 
181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  41.29 
 
 
208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  36.78 
 
 
204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.85 
 
 
207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  37.65 
 
 
195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  38.41 
 
 
195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2666  co-chaperone GrpE  37.58 
 
 
171 aa  108  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.832748  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  40.74 
 
 
189 aa  108  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  40.43 
 
 
205 aa  108  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2292  GrpE protein  37.58 
 
 
171 aa  108  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0174464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  38.1 
 
 
205 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  42.38 
 
 
178 aa  108  6e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  40.4 
 
 
210 aa  107  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  39.74 
 
 
194 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  35.06 
 
 
189 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  36.91 
 
 
213 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  40.52 
 
 
230 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  42.58 
 
 
198 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 
195 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  40.52 
 
 
230 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  36.41 
 
 
186 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  40.44 
 
 
198 aa  107  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  40.41 
 
 
201 aa  106  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 
201 aa  105  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  33.16 
 
 
207 aa  105  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  32.61 
 
 
202 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  37.3 
 
 
209 aa  105  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  36.05 
 
 
187 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  42.5 
 
 
184 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  32.61 
 
 
202 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  38.52 
 
 
198 aa  105  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  37.75 
 
 
195 aa  105  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1527  heat shock protein GrpE  38.75 
 
 
189 aa  105  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  40.14 
 
 
190 aa  105  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  41.29 
 
 
200 aa  105  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  36.49 
 
 
186 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2497  putative heat shock protein  35.71 
 
 
182 aa  104  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.437332 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  42.22 
 
 
193 aa  104  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  39.38 
 
 
188 aa  104  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  36.05 
 
 
187 aa  104  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  42.95 
 
 
213 aa  104  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  40.26 
 
 
231 aa  104  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  38.36 
 
 
245 aa  104  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  36 
 
 
208 aa  104  9e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  40.54 
 
 
184 aa  103  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  38.75 
 
 
186 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  37.18 
 
 
179 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  36 
 
 
204 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  36.99 
 
 
260 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1974  GrpE protein  33.95 
 
 
210 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.26677  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  39.35 
 
 
210 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  40.71 
 
 
194 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  35 
 
 
186 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  37.86 
 
 
195 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  35.9 
 
 
208 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  39.35 
 
 
197 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  43.97 
 
 
181 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  39.47 
 
 
192 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  35 
 
 
186 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  40.28 
 
 
197 aa  102  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  41.13 
 
 
178 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  39.47 
 
 
192 aa  102  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  39.47 
 
 
192 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  42.18 
 
 
180 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  38.51 
 
 
193 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  36.63 
 
 
179 aa  102  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  35.71 
 
 
197 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>