More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3533 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  100 
 
 		 189 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  68.39 
 
 		 200 aa  242  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  62.63 
 
 		 188 aa  241  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  63.16 
 
 		 186 aa  241  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  64.77 
 
 		 199 aa  224  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  58.96 
 
 		 190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  62.91 
 
 		 181 aa  204  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  50.57 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  48.99 
 
 		 189 aa  143  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  43.35 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  43.95 
 
 		 195 aa  135  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  47.56 
 
 		 185 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  45.62 
 
 		 210 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  46.95 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  45.51 
 
 		 209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  44.87 
 
 		 200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  45.58 
 
 		 208 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  41.48 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  41.44 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  43.02 
 
 		 195 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  43.98 
 
 		 209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  43.02 
 
 		 195 aa  128  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  41.77 
 
 		 211 aa  128  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  42.6 
 
 		 195 aa  127  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  41.86 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  44.23 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  43.93 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  43.59 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  44.97 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  43.56 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  44.87 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  42.61 
 
 		 192 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  42.61 
 
 		 192 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  42.61 
 
 		 192 aa  125  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  44.3 
 
 		 199 aa  124  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  40.66 
 
 		 195 aa  124  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  43.29 
 
 		 213 aa  124  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  42.68 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.68 
 
 		 197 aa  123  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  42.68 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  44.85 
 
 		 250 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  44.85 
 
 		 241 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  44.85 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  44.85 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  40.11 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  42.68 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  42.68 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  42.68 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  44.85 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  42.68 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  42.68 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  39.77 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  40.91 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  40.91 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  40.91 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  41.91 
 
 		 197 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  40.91 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  40.91 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  40.91 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  40.91 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  42.95 
 
 		 217 aa  122  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  42.07 
 
 		 196 aa  122  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  41.03 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  42.95 
 
 		 187 aa  121  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  42.95 
 
 		 187 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  40.12 
 
 		 185 aa  121  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  38.27 
 
 		 260 aa  121  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  45.59 
 
 		 204 aa  121  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  41.61 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  41.06 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  40.4 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  43.59 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  39.77 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  36.92 
 
 		 204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  42.31 
 
 		 178 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  42.86 
 
 		 187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  44.85 
 
 		 205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  45.81 
 
 		 231 aa  118  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  39.74 
 
 		 194 aa  117  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  38.46 
 
 		 193 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  42.31 
 
 		 209 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  40.22 
 
 		 189 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  41.46 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  38.61 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  41.03 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  41.03 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  41.77 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  45.59 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  40.38 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  40.38 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  42.65 
 
 		 210 aa  115  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  40.38 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  40.59 
 
 		 187 aa  115  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  39.74 
 
 		 206 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  39.74 
 
 		 206 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  39.74 
 
 		 206 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  39.74 
 
 		 206 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  40.13 
 
 		 204 aa  114  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  43.75 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>