More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3010 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  100 
 
 		 250 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  100 
 
 		 241 aa  480  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  100 
 
 		 196 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  100 
 
 		 196 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  100 
 
 		 196 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  92.86 
 
 		 197 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  92.35 
 
 		 197 aa  367  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  92.86 
 
 		 197 aa  368  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  92.86 
 
 		 197 aa  368  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  92.86 
 
 		 196 aa  367  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  92.86 
 
 		 197 aa  368  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  92.86 
 
 		 197 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  92.35 
 
 		 197 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  92.35 
 
 		 196 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  89.8 
 
 		 197 aa  355  3.9999999999999996e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  64.29 
 
 		 190 aa  245  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  58.29 
 
 		 195 aa  233  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  59.18 
 
 		 192 aa  231  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  59.18 
 
 		 192 aa  231  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  59.18 
 
 		 192 aa  231  6e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  56.78 
 
 		 195 aa  231  8.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  56.28 
 
 		 195 aa  228  9e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  57.36 
 
 		 195 aa  226  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  57.8 
 
 		 198 aa  211  1e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  53.12 
 
 		 198 aa  158  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  46.52 
 
 		 209 aa  156  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  47.98 
 
 		 187 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  45.08 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  49.38 
 
 		 212 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  48.19 
 
 		 189 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  41.71 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  44.71 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  49.67 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  46 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  49.67 
 
 		 187 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  42.29 
 
 		 200 aa  149  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  48.37 
 
 		 195 aa  148  7e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  49.28 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  42.79 
 
 		 209 aa  146  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  49.28 
 
 		 200 aa  146  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  42.05 
 
 		 189 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  44.17 
 
 		 211 aa  145  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  50.33 
 
 		 210 aa  145  8.000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  45.81 
 
 		 206 aa  145  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  48.39 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  48.39 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  45.81 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  45.81 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  44.44 
 
 		 206 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0916  co-chaperone GrpE  50.33 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.764305  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  50.72 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  49.02 
 
 		 184 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  47.44 
 
 		 206 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  47.44 
 
 		 206 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  47.44 
 
 		 206 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  47.44 
 
 		 206 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  48.05 
 
 		 189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  43.07 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  46.79 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  45.24 
 
 		 245 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  46.15 
 
 		 201 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  44.87 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  44.74 
 
 		 186 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  46.41 
 
 		 184 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  42.5 
 
 		 187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  44.75 
 
 		 193 aa  131  9e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  47.3 
 
 		 185 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  44.74 
 
 		 184 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  47.1 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  43.75 
 
 		 190 aa  128  7.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  37.06 
 
 		 210 aa  125  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  44.85 
 
 		 189 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  39.59 
 
 		 208 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  45.99 
 
 		 193 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  38.46 
 
 		 189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  43.54 
 
 		 199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  44.93 
 
 		 181 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  44.93 
 
 		 181 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  44.93 
 
 		 181 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  44.93 
 
 		 178 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1537  molecular chaperone protein GrpE  47.45 
 
 		 173 aa  119  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.818468  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  45.65 
 
 		 181 aa  118  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  44.93 
 
 		 185 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  44.93 
 
 		 185 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  38.35 
 
 		 199 aa  118  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  44.93 
 
 		 185 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  44.93 
 
 		 185 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  44.93 
 
 		 185 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  44.93 
 
 		 185 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  44.93 
 
 		 185 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  40.52 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  43.48 
 
 		 181 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  37.79 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  43.14 
 
 		 194 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  37.04 
 
 		 213 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0924  GrpE protein  43.59 
 
 		 184 aa  115  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.929146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  44.93 
 
 		 181 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  44.93 
 
 		 181 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  36 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  44.2 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>