More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2165 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2165  GrpE protein  100 
 
 		 191 aa  387  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.281053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  67.42 
 
 		 201 aa  236  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  64 
 
 		 194 aa  197  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  48.21 
 
 		 195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  58.7 
 
 		 207 aa  164  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  47.01 
 
 		 181 aa  137  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  43.75 
 
 		 189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  40.85 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  40.85 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  47.01 
 
 		 198 aa  111  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  43.7 
 
 		 192 aa  111  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  43.7 
 
 		 192 aa  111  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  43.7 
 
 		 192 aa  111  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  41.04 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  40.14 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  39.44 
 
 		 184 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  40.97 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  42.22 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  41.67 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  38.52 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  41.48 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  36.5 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  42.42 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  36.5 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  42.14 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  41.79 
 
 		 211 aa  104  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  40.6 
 
 		 199 aa  104  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  37.04 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  37.4 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  39.85 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  39.72 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  36.64 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  38.03 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  35.88 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  35.88 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  35.88 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  35.88 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  31.31 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  35.88 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  32.63 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  38.03 
 
 		 187 aa  101  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  31.07 
 
 		 192 aa  101  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  39.39 
 
 		 212 aa  101  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  40.91 
 
 		 213 aa  101  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  35.88 
 
 		 188 aa  101  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  35.88 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  35.88 
 
 		 188 aa  101  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  39.39 
 
 		 200 aa  101  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  35.88 
 
 		 198 aa  101  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  36.42 
 
 		 181 aa  101  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  39.16 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  38.64 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  37.96 
 
 		 193 aa  99.8  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  37.06 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  40.15 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  40.15 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  35.81 
 
 		 197 aa  98.2  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  39.44 
 
 		 209 aa  98.2  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  37.76 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  39.73 
 
 		 210 aa  97.1  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  38.73 
 
 		 189 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0674  grpE protein  35 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.04297  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  37.76 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  40.29 
 
 		 210 aa  96.3  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1090  co-chaperone GrpE  35.42 
 
 		 173 aa  95.9  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000331967  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  36.81 
 
 		 200 aa  96.3  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  37.32 
 
 		 206 aa  95.5  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  33.33 
 
 		 187 aa  95.1  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  33.13 
 
 		 194 aa  95.1  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.56 
 
 		 189 aa  95.5  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  34.29 
 
 		 191 aa  94.7  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  36.62 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  38.97 
 
 		 176 aa  94.4  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2133  HSP70 family protein GrpE  37.11 
 
 		 199 aa  94.4  9e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0603928  normal  0.40294 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  36.62 
 
 		 203 aa  94.4  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  33.73 
 
 		 175 aa  93.6  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  42.52 
 
 		 244 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  34.68 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  37.32 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  36.62 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  35.92 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  35.92 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  35.71 
 
 		 173 aa  93.6  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  35.92 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  35.92 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2457  GrpE protein  34.36 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.23302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  37.59 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  40.58 
 
 		 213 aa  92.4  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  35.92 
 
 		 203 aa  92.4  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  40.58 
 
 		 225 aa  92.4  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  30.86 
 
 		 186 aa  92  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4434  GrpE protein  39.16 
 
 		 174 aa  92  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1259  heat shock protein GrpE  36.08 
 
 		 176 aa  92  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.481119  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  33.33 
 
 		 217 aa  91.7  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  35.29 
 
 		 204 aa  91.7  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 		 208 aa  91.7  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  39.39 
 
 		 172 aa  91.3  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>