More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3222 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  100 
 
 
204 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  50 
 
 
192 aa  175  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  44.91 
 
 
213 aa  156  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  47.67 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  43.39 
 
 
188 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  43.39 
 
 
188 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  43.39 
 
 
188 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  43.39 
 
 
188 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  43.39 
 
 
188 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  43.39 
 
 
188 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  43.39 
 
 
188 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  43.92 
 
 
188 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  46.41 
 
 
192 aa  141  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  44.59 
 
 
192 aa  141  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  47.56 
 
 
208 aa  140  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  45.22 
 
 
198 aa  140  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  51.82 
 
 
213 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  42.16 
 
 
210 aa  136  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  46.79 
 
 
231 aa  132  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  44.16 
 
 
195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  43.14 
 
 
226 aa  131  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  38.83 
 
 
190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  44.52 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  45.45 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  45.81 
 
 
201 aa  125  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  40.22 
 
 
181 aa  124  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  41.03 
 
 
181 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  44.29 
 
 
189 aa  122  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  40 
 
 
202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  39.88 
 
 
204 aa  118  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  40.36 
 
 
223 aa  117  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  42.11 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  40.12 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  45.52 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1605  GrpE protein  41.03 
 
 
162 aa  116  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0303276  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  41.14 
 
 
242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  41.03 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  41.03 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  41.61 
 
 
239 aa  114  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  45.19 
 
 
246 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  40.85 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  40.43 
 
 
199 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  39.57 
 
 
174 aa  112  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 
191 aa  112  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  42.45 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  42.14 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  39.64 
 
 
225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  40.88 
 
 
239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  36.72 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  40.88 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  37.57 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  36.55 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  40.52 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  41.79 
 
 
239 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  37.25 
 
 
175 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  35.54 
 
 
210 aa  108  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  32.68 
 
 
244 aa  107  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  38.69 
 
 
224 aa  107  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  47.79 
 
 
208 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  38.97 
 
 
243 aa  107  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  39.42 
 
 
217 aa  106  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  36.72 
 
 
184 aa  106  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  38.57 
 
 
189 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  37.28 
 
 
238 aa  106  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  34.34 
 
 
193 aa  105  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  43.61 
 
 
172 aa  105  6e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  38.82 
 
 
282 aa  104  8e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0439  GrpE protein  40.72 
 
 
171 aa  104  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00290609  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00151  heat shock protein GrpE  40.88 
 
 
239 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0924  GrpE protein  35.8 
 
 
184 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.929146  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  33.16 
 
 
247 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  31.52 
 
 
225 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  38.3 
 
 
173 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  35.11 
 
 
210 aa  102  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  34.59 
 
 
187 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  39.29 
 
 
207 aa  102  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  31.31 
 
 
195 aa  102  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  33.66 
 
 
211 aa  102  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  42.86 
 
 
172 aa  101  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  33.52 
 
 
178 aa  101  6e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  35.23 
 
 
201 aa  101  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0648  GrpE protein  37.09 
 
 
188 aa  101  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  36.76 
 
 
179 aa  101  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  35 
 
 
260 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4329  GrpE protein  34.43 
 
 
242 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.134987  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  36.36 
 
 
261 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  36.84 
 
 
193 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  36.36 
 
 
261 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  39.74 
 
 
237 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  40.74 
 
 
259 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  40.74 
 
 
259 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  32.6 
 
 
186 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  39.42 
 
 
224 aa  99.8  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  32.04 
 
 
188 aa  99.4  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  33.33 
 
 
201 aa  99  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  37.59 
 
 
198 aa  99.4  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  32.47 
 
 
205 aa  99  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  33.81 
 
 
181 aa  98.6  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  38.19 
 
 
200 aa  98.6  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  35.23 
 
 
178 aa  98.6  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>