More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0674 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0674  grpE protein  100 
 
 		 190 aa  388  1e-107  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.04297  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  36.47 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  38.46 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  39.55 
 
 		 194 aa  98.6  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  34.76 
 
 		 206 aa  98.6  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  35.95 
 
 		 248 aa  97.1  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  37.18 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2165  GrpE protein  35 
 
 		 191 aa  96.3  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.281053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  36.54 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  33.51 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  35.1 
 
 		 156 aa  95.1  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  33.72 
 
 		 181 aa  94.4  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  35.07 
 
 		 198 aa  94  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  38.62 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  35.85 
 
 		 187 aa  92.8  2e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  34.59 
 
 		 213 aa  92.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  33.99 
 
 		 223 aa  92.4  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  32.72 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  37.97 
 
 		 226 aa  92.4  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  33.55 
 
 		 190 aa  91.7  7e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  37.93 
 
 		 179 aa  91.7  7e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  39.42 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  35.33 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  32.42 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  35.29 
 
 		 244 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  33.71 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  32.34 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  32.68 
 
 		 201 aa  89.4  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0101  GrpE protein  37.5 
 
 		 186 aa  89  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.552759  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  35.23 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  34.97 
 
 		 207 aa  88.6  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 192 aa  88.6  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  32.39 
 
 		 242 aa  88.2  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  32.14 
 
 		 181 aa  88.2  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1513  heat shock protein GrpE  32.02 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  30.81 
 
 		 173 aa  87.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  31.82 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  32.12 
 
 		 246 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  31.07 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1456  heat shock protein GrpE  32.02 
 
 		 172 aa  87  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.022256  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  34.13 
 
 		 192 aa  86.3  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  34.06 
 
 		 204 aa  86.3  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  34.84 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  34.84 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  31.43 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  33.12 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0648  GrpE protein  32.43 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  34.13 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  36.11 
 
 		 207 aa  85.9  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  32.26 
 
 		 282 aa  86.3  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  31.76 
 
 		 211 aa  85.9  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  32.18 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  31.49 
 
 		 204 aa  85.9  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  32.02 
 
 		 179 aa  86.3  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  34.78 
 
 		 200 aa  85.9  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  35.4 
 
 		 206 aa  85.5  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  33.33 
 
 		 217 aa  85.5  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  33.97 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  35.77 
 
 		 189 aa  84.7  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  30.82 
 
 		 195 aa  84.3  9e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  31.76 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  32.9 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  32.3 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  31.4 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  35.71 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  29.21 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  30.72 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  31.43 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  30.99 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  30.11 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  33.97 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  32.39 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  35.66 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  35.97 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  33.14 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  31.21 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  31.54 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  29.38 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  31.97 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0627  co-chaperone protein GrpE  37.24 
 
 		 247 aa  81.6  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0327836  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  32 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  33.55 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1182  molecular chaperone  32.61 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00339423  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  31.76 
 
 		 225 aa  81.3  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  31.43 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  30.28 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  28.49 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  29.03 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  30.49 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1209  GrpE protein  31.69 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.177941  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1090  co-chaperone GrpE  33.78 
 
 		 173 aa  80.9  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000331967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  29.78 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  31.58 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  29.94 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  31.58 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  31.58 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  31.65 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  31.58 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  31.58 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>