More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7788 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  100 
 
 		 181 aa  363  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  50.32 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  44.94 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  45.39 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  44.94 
 
 		 211 aa  131  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.76 
 
 		 217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  44.74 
 
 		 222 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  43.56 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  41.18 
 
 		 206 aa  127  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  42.5 
 
 		 230 aa  127  8.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  42.5 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  44.74 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  40.99 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  45.33 
 
 		 213 aa  124  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  41.72 
 
 		 202 aa  125  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.98 
 
 		 202 aa  124  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  40.12 
 
 		 206 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.94 
 
 		 204 aa  123  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  44.08 
 
 		 202 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  43.31 
 
 		 260 aa  122  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 186 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  41.29 
 
 		 210 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  44.16 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  41.18 
 
 		 208 aa  121  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 206 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.52 
 
 		 207 aa  121  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  40.59 
 
 		 210 aa  121  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  45.99 
 
 		 198 aa  121  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  40.61 
 
 		 203 aa  120  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  43.42 
 
 		 200 aa  120  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  43.59 
 
 		 186 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3643  GrpE protein  41.67 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  41.5 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  41.5 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  39.39 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  42.57 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  44.06 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  41.43 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  41.5 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  40.57 
 
 		 179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  39.43 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 		 198 aa  115  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  40.15 
 
 		 195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  41.43 
 
 		 210 aa  115  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  40.14 
 
 		 206 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  35.71 
 
 		 173 aa  114  7.999999999999999e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  39.16 
 
 		 209 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  41.43 
 
 		 203 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  39.16 
 
 		 212 aa  114  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  40.67 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  40.67 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  38.92 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  39.16 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  43.38 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  42.86 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  42.04 
 
 		 179 aa  111  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0800  heat shock protein GrpE  38.67 
 
 		 189 aa  111  7.000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.200393  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  42.03 
 
 		 192 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  42.03 
 
 		 192 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 		 184 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  42.03 
 
 		 192 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  42.75 
 
 		 195 aa  110  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  41.61 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  40.71 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  38.31 
 
 		 209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0208  GrpE protein  37.84 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  39.33 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  40.88 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  38.51 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  38.03 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  35.43 
 
 		 200 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  38.51 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  38.51 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  38.51 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  39.49 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  38.51 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  37.74 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  39.42 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  42.03 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  39.86 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  40.3 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  36.05 
 
 		 181 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15032  predicted protein  41.1 
 
 		 157 aa  107  8.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189878  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  41.3 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  39.38 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  39.86 
 
 		 190 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  40.94 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  39.13 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  41.32 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  37.58 
 
 		 187 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  38.69 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  38.71 
 
 		 187 aa  104  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  40.4 
 
 		 181 aa  104  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  38.71 
 
 		 187 aa  104  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  38.41 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  39.42 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>