More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0188 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  100 
 
 		 206 aa  413  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  84.9 
 
 		 205 aa  330  8e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  80.49 
 
 		 207 aa  327  6e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  81 
 
 		 206 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  81.28 
 
 		 206 aa  310  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  78.69 
 
 		 203 aa  294  7e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  74.86 
 
 		 197 aa  276  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  66.26 
 
 		 222 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  65.43 
 
 		 210 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.77 
 
 		 202 aa  221  6e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  57.28 
 
 		 202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  57.56 
 
 		 208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.5 
 
 		 204 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  66.45 
 
 		 202 aa  217  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  61.9 
 
 		 210 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  62.99 
 
 		 204 aa  208  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.67 
 
 		 207 aa  206  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  63.29 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.08 
 
 		 217 aa  204  8e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  62.58 
 
 		 187 aa  203  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  66.9 
 
 		 230 aa  202  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  66.21 
 
 		 230 aa  201  6e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  63.45 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  54.35 
 
 		 201 aa  196  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  50.24 
 
 		 222 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  48.41 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  43.09 
 
 		 181 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  47.1 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  46.31 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15032  predicted protein  44.16 
 
 		 157 aa  135  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189878  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  47.1 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14947  mitochondrial GrpE-like protein  44.97 
 
 		 240 aa  132  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0088904  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  46.31 
 
 		 181 aa  131  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  44.97 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  47.77 
 
 		 189 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  47.77 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  45.1 
 
 		 197 aa  128  7.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  41.18 
 
 		 181 aa  127  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1974  GrpE protein  46.1 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.26677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  47.02 
 
 		 179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  45.58 
 
 		 187 aa  124  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3643  GrpE protein  41.56 
 
 		 221 aa  121  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  42.21 
 
 		 206 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  42.21 
 
 		 206 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  38.66 
 
 		 193 aa  121  9e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  42.21 
 
 		 206 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  42.21 
 
 		 206 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  41.77 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  42.21 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0208  GrpE protein  43.05 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  40.26 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1647  GrpE protein  43.14 
 
 		 202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.165316  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  39.73 
 
 		 205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  42.21 
 
 		 203 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  41.56 
 
 		 206 aa  118  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  40.41 
 
 		 201 aa  118  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  40.91 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  41.56 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  40.85 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64096  predicted protein  40.38 
 
 		 188 aa  117  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  0.0799005 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  41.96 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  42.07 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  41.38 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  37.65 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  43.15 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  41.29 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  40.14 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  42.57 
 
 		 209 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 194 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  37.91 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  39.22 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0800  heat shock protein GrpE  35.95 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.200393  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  35.36 
 
 		 250 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  35.36 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  35.36 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  35.36 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  35.36 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  35.52 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  35.52 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  35.52 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  39.86 
 
 		 192 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  35.52 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  42.58 
 
 		 194 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  43.24 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  35.52 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  35.52 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  33.51 
 
 		 189 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  35.36 
 
 		 196 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  40.85 
 
 		 195 aa  106  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  35.84 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  44.74 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02220  grpe protein, putative  40.46 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  35.29 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  35.52 
 
 		 197 aa  105  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  35.36 
 
 		 196 aa  105  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  40.43 
 
 		 189 aa  105  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>