More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0393 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  100 
 
 		 206 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  93.1 
 
 		 206 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  84.47 
 
 		 207 aa  349  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  81.91 
 
 		 206 aa  330  7.000000000000001e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  81.77 
 
 		 205 aa  316  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  79.23 
 
 		 203 aa  301  6.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  75.41 
 
 		 197 aa  284  5.999999999999999e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  65.64 
 
 		 210 aa  222  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  69.93 
 
 		 204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  68.42 
 
 		 208 aa  218  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.2 
 
 		 217 aa  216  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  62.72 
 
 		 210 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  67.55 
 
 		 202 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  66.45 
 
 		 202 aa  214  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.45 
 
 		 202 aa  214  9e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  62.5 
 
 		 204 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.9 
 
 		 207 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  60.12 
 
 		 222 aa  206  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  60.59 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  62.89 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  60 
 
 		 230 aa  205  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  61.88 
 
 		 226 aa  203  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  63.87 
 
 		 187 aa  201  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  55.68 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  60 
 
 		 201 aa  192  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  48.7 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  49.66 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  49.65 
 
 		 181 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15032  predicted protein  44.16 
 
 		 157 aa  137  8.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189878  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  44.32 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  47.02 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  43.15 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  47.74 
 
 		 205 aa  133  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  49.03 
 
 		 179 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  44.32 
 
 		 186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14947  mitochondrial GrpE-like protein  43.62 
 
 		 240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0088904  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  44.16 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3643  GrpE protein  45.91 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  46.31 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  43.03 
 
 		 186 aa  128  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1974  GrpE protein  46.15 
 
 		 210 aa  127  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.26677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0208  GrpE protein  40.86 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  43.15 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  43.15 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  40.35 
 
 		 181 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  42.86 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  42.67 
 
 		 194 aa  121  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  44.9 
 
 		 187 aa  121  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  42.76 
 
 		 206 aa  121  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  43.45 
 
 		 200 aa  121  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  40.41 
 
 		 209 aa  121  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  44.67 
 
 		 193 aa  121  9e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  40.37 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  40.91 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  41.55 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  40.37 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  40.37 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  40.37 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  42.55 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  41.38 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  42.07 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  43.15 
 
 		 209 aa  118  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  43.36 
 
 		 200 aa  117  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  41.38 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  40.56 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  41.5 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64096  predicted protein  38.18 
 
 		 188 aa  114  8.999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  0.0799005 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  40.85 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0800  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 		 189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.200393  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  40.67 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  45.52 
 
 		 180 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  41.61 
 
 		 181 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  38.62 
 
 		 190 aa  111  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  44.76 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1647  GrpE protein  43.59 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.165316  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0924  GrpE protein  43.05 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.929146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  44 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  44.3 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  32.81 
 
 		 186 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  40.41 
 
 		 199 aa  108  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  35.12 
 
 		 189 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  41.88 
 
 		 207 aa  108  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  43.06 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  36.53 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  43.06 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  39.73 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  43.06 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  43.06 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  43.06 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  43.06 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  43.06 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  43.06 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  41.78 
 
 		 181 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  43.66 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  41.78 
 
 		 181 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  42.28 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  42.36 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  45.64 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>