More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A0498 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  100 
 
 
185 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  100 
 
 
185 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  100 
 
 
185 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  100 
 
 
185 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  100 
 
 
185 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  100 
 
 
185 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  100 
 
 
185 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  93.51 
 
 
178 aa  303  9.000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  85.95 
 
 
181 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  83.78 
 
 
181 aa  275  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  83.78 
 
 
181 aa  275  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  83.78 
 
 
181 aa  275  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  83.78 
 
 
181 aa  275  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  82.16 
 
 
181 aa  269  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  82.16 
 
 
181 aa  269  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  73.71 
 
 
194 aa  265  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  75.25 
 
 
202 aa  254  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  75.77 
 
 
194 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2468  heat shock protein GrpE  76.55 
 
 
215 aa  229  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.338096  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2874  heat shock protein GrpE  75.86 
 
 
215 aa  226  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2639  heat shock protein GrpE  79.7 
 
 
214 aa  223  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  64 
 
 
180 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  61.96 
 
 
184 aa  219  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  60.12 
 
 
184 aa  204  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  59.46 
 
 
182 aa  204  8e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  69.18 
 
 
181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1527  heat shock protein GrpE  60.43 
 
 
189 aa  198  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  67.81 
 
 
189 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  67.81 
 
 
178 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  67.81 
 
 
178 aa  192  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  60.74 
 
 
186 aa  189  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  52.53 
 
 
207 aa  189  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  67.12 
 
 
181 aa  187  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2497  putative heat shock protein  61.69 
 
 
182 aa  185  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.437332 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0924  GrpE protein  57.41 
 
 
184 aa  180  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.929146  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2575  GrpE protein  64.24 
 
 
181 aa  180  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160939 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1970  GrpE protein  54.3 
 
 
187 aa  179  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000003831  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  60.51 
 
 
179 aa  178  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  55.41 
 
 
185 aa  167  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  48.59 
 
 
193 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  52.51 
 
 
184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  58.22 
 
 
245 aa  160  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1537  molecular chaperone protein GrpE  57.46 
 
 
173 aa  152  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.818468  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  48.94 
 
 
211 aa  150  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  53.33 
 
 
194 aa  150  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  51.33 
 
 
209 aa  145  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  49.17 
 
 
187 aa  144  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  44.44 
 
 
195 aa  142  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  53.19 
 
 
205 aa  141  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  43.39 
 
 
195 aa  141  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  43.85 
 
 
194 aa  141  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  49.33 
 
 
200 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  42.25 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  48.8 
 
 
189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  44.27 
 
 
218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  41.42 
 
 
186 aa  139  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  51.03 
 
 
192 aa  137  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  44.21 
 
 
195 aa  137  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  41.71 
 
 
185 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  49.33 
 
 
209 aa  137  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  48.67 
 
 
198 aa  137  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  47.33 
 
 
200 aa  136  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  48.67 
 
 
201 aa  136  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  43.92 
 
 
190 aa  134  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  48.67 
 
 
206 aa  134  8e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  48.67 
 
 
206 aa  134  8e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  48.67 
 
 
206 aa  134  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  48.67 
 
 
206 aa  134  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  45.11 
 
 
210 aa  133  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  46.67 
 
 
201 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  45.91 
 
 
184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  49.33 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  49.33 
 
 
206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  49.33 
 
 
203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  46 
 
 
212 aa  131  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  48.67 
 
 
203 aa  131  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  48.34 
 
 
209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  40 
 
 
190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  47.06 
 
 
195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  48 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  46.36 
 
 
213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  46.67 
 
 
240 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  48.23 
 
 
200 aa  129  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  43.6 
 
 
199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  46.98 
 
 
193 aa  127  6e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  46.81 
 
 
187 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  41.97 
 
 
196 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  44.58 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  41.97 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  41.97 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  41.97 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  46.1 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  41.97 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  41.97 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  41.97 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  40.11 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  41.97 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>