More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_15032 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_15032  predicted protein  100 
 
 
157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189878  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  48.03 
 
 
228 aa  144  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  48.03 
 
 
230 aa  140  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  44.16 
 
 
206 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  46.71 
 
 
222 aa  139  9.999999999999999e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.52 
 
 
217 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  45.45 
 
 
207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  47.37 
 
 
230 aa  138  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  45.95 
 
 
203 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  45.95 
 
 
197 aa  136  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  46.1 
 
 
205 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  44.08 
 
 
206 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  44.16 
 
 
206 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  44.08 
 
 
204 aa  130  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.76 
 
 
204 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  43.51 
 
 
210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 
208 aa  128  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 
210 aa  127  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14947  mitochondrial GrpE-like protein  43.59 
 
 
240 aa  126  9.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0088904  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  43.15 
 
 
202 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  42.21 
 
 
187 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42 
 
 
202 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  42 
 
 
202 aa  125  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.76 
 
 
207 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  42.11 
 
 
226 aa  124  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  42.11 
 
 
210 aa  124  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  42.21 
 
 
201 aa  122  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  42.48 
 
 
222 aa  123  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  41.18 
 
 
213 aa  120  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64096  predicted protein  40.88 
 
 
188 aa  118  3.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  0.0799005 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  37.25 
 
 
181 aa  111  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  36.36 
 
 
186 aa  111  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  36.36 
 
 
181 aa  108  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  41.67 
 
 
205 aa  107  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  41.1 
 
 
181 aa  107  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  35.19 
 
 
210 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0208  GrpE protein  37.25 
 
 
188 aa  101  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  38.56 
 
 
179 aa  100  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  35.95 
 
 
197 aa  99.4  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  35.29 
 
 
186 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  35.29 
 
 
189 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  35.06 
 
 
245 aa  98.6  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  37.01 
 
 
193 aa  98.2  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  36 
 
 
201 aa  98.2  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1647  GrpE protein  33.77 
 
 
202 aa  97.8  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.165316  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  35.29 
 
 
186 aa  97.1  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3643  GrpE protein  35.53 
 
 
221 aa  96.7  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  35.1 
 
 
194 aa  95.5  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  37.5 
 
 
210 aa  95.9  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  35.95 
 
 
187 aa  95.5  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02220  grpe protein, putative  41.86 
 
 
228 aa  95.1  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0111  GrpE protein  29.68 
 
 
199 aa  95.1  3e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  38.26 
 
 
194 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  37.33 
 
 
171 aa  94.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06248  mitochondrial co-chaperone GrpE, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13040)  39.87 
 
 
252 aa  94.4  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00156969  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1974  GrpE protein  31.82 
 
 
210 aa  93.6  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.26677  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  34.67 
 
 
201 aa  93.2  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  38.56 
 
 
189 aa  93.2  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_002978  WD0800  heat shock protein GrpE  32.03 
 
 
189 aa  92.4  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.200393  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 
207 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  36.36 
 
 
187 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  34.21 
 
 
209 aa  92  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  36.13 
 
 
195 aa  92  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  35.1 
 
 
198 aa  91.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  35.1 
 
 
211 aa  91.7  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  33.76 
 
 
195 aa  91.3  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  37.41 
 
 
194 aa  90.9  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  37.75 
 
 
180 aa  90.9  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  33.96 
 
 
195 aa  90.9  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  35.76 
 
 
212 aa  90.5  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  32.47 
 
 
189 aa  90.5  9e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  35.03 
 
 
195 aa  89.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  38.26 
 
 
181 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 
202 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  37.74 
 
 
181 aa  89.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  39.47 
 
 
178 aa  89.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  35.57 
 
 
206 aa  89  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  34.84 
 
 
192 aa  88.2  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  34.84 
 
 
192 aa  88.2  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  34.84 
 
 
192 aa  88.2  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  37.33 
 
 
184 aa  87.8  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  34.23 
 
 
203 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  34.23 
 
 
206 aa  87.8  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
205 aa  87.8  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  35.06 
 
 
179 aa  87.4  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  39.47 
 
 
178 aa  87.4  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  35.1 
 
 
200 aa  87  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  34.23 
 
 
206 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  32.24 
 
 
200 aa  86.3  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  36.91 
 
 
181 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  34.23 
 
 
206 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  34.23 
 
 
206 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  34.23 
 
 
206 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  36.91 
 
 
181 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  36.91 
 
 
181 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  33.56 
 
 
203 aa  87  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  33.33 
 
 
192 aa  86.3  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  36.91 
 
 
181 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  36.91 
 
 
181 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0168  co-chaperone GrpE  28.39 
 
 
203 aa  86.3  2e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>