More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0008 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  100 
 
 		 210 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  95.71 
 
 		 210 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  77.56 
 
 		 208 aa  310  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  74.38 
 
 		 204 aa  295  5e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  73.42 
 
 		 230 aa  248  6e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  74.52 
 
 		 228 aa  248  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  72.78 
 
 		 230 aa  246  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  66.48 
 
 		 222 aa  240  1e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  69.18 
 
 		 222 aa  232  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  59.2 
 
 		 206 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.7 
 
 		 204 aa  225  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  60.77 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  61.54 
 
 		 207 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  55.67 
 
 		 206 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  56.02 
 
 		 205 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.9 
 
 		 207 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.34 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  53.85 
 
 		 203 aa  208  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  56.99 
 
 		 206 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  62.91 
 
 		 202 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.91 
 
 		 202 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  62 
 
 		 202 aa  205  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  53.3 
 
 		 197 aa  205  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  53.43 
 
 		 201 aa  204  9e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  59.87 
 
 		 187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  52.87 
 
 		 213 aa  164  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  49.66 
 
 		 181 aa  148  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  46.53 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  44.91 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  47.8 
 
 		 189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  47.8 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  50 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  46.41 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0208  GrpE protein  42.37 
 
 		 188 aa  132  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1974  GrpE protein  41.45 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.26677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  44.16 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  48.87 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3643  GrpE protein  42.48 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  44.44 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14947  mitochondrial GrpE-like protein  43.95 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0088904  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  42.68 
 
 		 187 aa  128  8.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  43.37 
 
 		 194 aa  127  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15032  predicted protein  42.86 
 
 		 157 aa  127  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189878  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1647  GrpE protein  40 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.165316  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64096  predicted protein  40.12 
 
 		 188 aa  126  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  0.0799005 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  40.26 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  40.49 
 
 		 206 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  40.49 
 
 		 206 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  40.49 
 
 		 206 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  40.25 
 
 		 201 aa  124  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  40.49 
 
 		 206 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  40.41 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  42.07 
 
 		 179 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  40.65 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  40.41 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  41.29 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  40.41 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  42.07 
 
 		 200 aa  122  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  42.55 
 
 		 212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  43.66 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  39.6 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 		 195 aa  118  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  39.44 
 
 		 200 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  37.5 
 
 		 190 aa  117  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  41.44 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  39.16 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  34.12 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  43.23 
 
 		 179 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  40.64 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  40.49 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  41.45 
 
 		 187 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  39.31 
 
 		 205 aa  116  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  39.24 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  45.45 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  45.45 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  45.45 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  45.45 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  45.45 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  45.45 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  45.45 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  40.21 
 
 		 200 aa  115  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  40.54 
 
 		 194 aa  114  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  39.13 
 
 		 200 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  44.44 
 
 		 181 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  37.93 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  38.93 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  38.73 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  42.48 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  42.36 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  42.25 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  43.79 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  44.44 
 
 		 178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  34.04 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  34.04 
 
 		 250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  36.79 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  43.75 
 
 		 181 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  33.86 
 
 		 196 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  33.86 
 
 		 196 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>