More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1974 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1974  GrpE protein  100 
 
 		 210 aa  427  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.26677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1647  GrpE protein  56.21 
 
 		 202 aa  192  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.165316  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  43.04 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  47.22 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  44.44 
 
 		 230 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  44.44 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.88 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.1 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  44 
 
 		 204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  46.1 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  46.15 
 
 		 202 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  39.31 
 
 		 210 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  42.07 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  40.78 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  42.21 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  46.05 
 
 		 206 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  47.33 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  40.8 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  40.49 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  41.4 
 
 		 187 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  45.77 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  40.97 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  39.16 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  44.9 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  42.95 
 
 		 193 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  39.78 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.79 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.86 
 
 		 207 aa  121  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  38.55 
 
 		 185 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  41.03 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  35.96 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  43.15 
 
 		 181 aa  119  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 187 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 187 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  39.22 
 
 		 187 aa  117  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  39.39 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  35.84 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  38.92 
 
 		 201 aa  116  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  38.56 
 
 		 189 aa  115  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  41.89 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  36.09 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  40.76 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  41.14 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  34.29 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  35.85 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  38.92 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  34.29 
 
 		 203 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  35.2 
 
 		 200 aa  111  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  37.91 
 
 		 189 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  38.56 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  34.29 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  34.29 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  34.29 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  34.29 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  35.76 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  34.29 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  39.22 
 
 		 187 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  39.1 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  33.71 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  35.81 
 
 		 205 aa  108  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  33.71 
 
 		 203 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  33.75 
 
 		 185 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  41.1 
 
 		 210 aa  107  9.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  40.4 
 
 		 186 aa  107  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  37.01 
 
 		 210 aa  107  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  33.14 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  34.59 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  37.87 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  35.45 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  40.25 
 
 		 190 aa  106  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  33.13 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  38.96 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  36 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  37.87 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  35.62 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0800  heat shock protein GrpE  30.41 
 
 		 189 aa  105  6e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.200393  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  34.48 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  37.59 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  33.95 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  37.71 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  33.15 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3643  GrpE protein  32.35 
 
 		 221 aa  102  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  35.22 
 
 		 194 aa  102  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2372  GrpE protein  32.76 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.919254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  32.7 
 
 		 217 aa  102  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  36.14 
 
 		 195 aa  101  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  33.96 
 
 		 198 aa  101  8e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  33.11 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  39.01 
 
 		 198 aa  99.8  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64096  predicted protein  36.99 
 
 		 188 aa  99.8  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  0.0799005 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  36.25 
 
 		 192 aa  99.8  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  36.25 
 
 		 192 aa  99.8  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  36.25 
 
 		 192 aa  99.8  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  36.18 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35 
 
 		 189 aa  99.8  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  33.76 
 
 		 213 aa  98.6  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  35.5 
 
 		 241 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  35.5 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>