More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1857 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  100 
 
 
185 aa  368  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  55.98 
 
 
187 aa  191  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  52.2 
 
 
185 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  51.57 
 
 
185 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  57.62 
 
 
193 aa  173  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  49.72 
 
 
218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  51.85 
 
 
184 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  54.61 
 
 
240 aa  169  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  50.92 
 
 
210 aa  167  9e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  55.32 
 
 
181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  55.32 
 
 
181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  55.32 
 
 
181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  53.9 
 
 
181 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  53.9 
 
 
181 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  47.85 
 
 
187 aa  161  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  47.03 
 
 
189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2639  heat shock protein GrpE  53.85 
 
 
214 aa  161  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  50.98 
 
 
209 aa  160  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2468  heat shock protein GrpE  55.24 
 
 
215 aa  160  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.338096  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  52.74 
 
 
184 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  54.42 
 
 
245 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  50.69 
 
 
187 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  53.19 
 
 
181 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  50.69 
 
 
187 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  47.9 
 
 
186 aa  158  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  48.57 
 
 
211 aa  159  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2874  heat shock protein GrpE  54.55 
 
 
215 aa  158  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  50.97 
 
 
194 aa  158  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  46.11 
 
 
180 aa  157  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  49.69 
 
 
199 aa  157  7e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  53.74 
 
 
184 aa  157  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  52.82 
 
 
190 aa  157  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  53.19 
 
 
181 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  56.2 
 
 
202 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  55.4 
 
 
178 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  50 
 
 
200 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  55.4 
 
 
185 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  55.4 
 
 
185 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  49.06 
 
 
199 aa  156  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  55.4 
 
 
185 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  55.4 
 
 
185 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  55.4 
 
 
185 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  50 
 
 
209 aa  155  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  52.9 
 
 
205 aa  156  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  51.37 
 
 
186 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  55.4 
 
 
185 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  55.4 
 
 
185 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  50.64 
 
 
194 aa  155  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  50.68 
 
 
189 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  53.62 
 
 
194 aa  151  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  49.66 
 
 
189 aa  150  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  48.08 
 
 
200 aa  150  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  53.42 
 
 
210 aa  149  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  48.37 
 
 
201 aa  149  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  51.08 
 
 
200 aa  148  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  49.69 
 
 
193 aa  148  6e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  52 
 
 
207 aa  147  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  48.37 
 
 
201 aa  147  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  50 
 
 
190 aa  146  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  49.38 
 
 
184 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  44.86 
 
 
195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  47.44 
 
 
198 aa  144  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  47.37 
 
 
206 aa  145  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  46.41 
 
 
203 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  46.05 
 
 
206 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  46.05 
 
 
206 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  46.05 
 
 
206 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  48.47 
 
 
184 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  48.24 
 
 
186 aa  143  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  46.05 
 
 
206 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  46.05 
 
 
206 aa  142  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0924  GrpE protein  47.49 
 
 
184 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.929146  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  45.98 
 
 
178 aa  142  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  51.47 
 
 
204 aa  142  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  48.65 
 
 
212 aa  142  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1527  heat shock protein GrpE  46.89 
 
 
189 aa  142  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  45.39 
 
 
206 aa  142  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  45.75 
 
 
203 aa  141  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  51.75 
 
 
179 aa  141  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  49.07 
 
 
195 aa  141  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  45.29 
 
 
195 aa  141  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  45.41 
 
 
195 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  46.34 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  46.34 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  46.34 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  44.83 
 
 
189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  45.98 
 
 
178 aa  139  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  49.67 
 
 
182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  46.62 
 
 
198 aa  138  4.999999999999999e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0916  co-chaperone GrpE  46.36 
 
 
206 aa  138  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.764305  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  47.68 
 
 
192 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  49.32 
 
 
181 aa  136  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  46.15 
 
 
195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2497  putative heat shock protein  49.04 
 
 
182 aa  135  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.437332 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1456  heat shock protein GrpE  45.86 
 
 
172 aa  134  5e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.022256  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1537  molecular chaperone protein GrpE  51.45 
 
 
173 aa  134  8e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.818468  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  48.12 
 
 
194 aa  134  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1513  heat shock protein GrpE  53.03 
 
 
200 aa  134  9e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  44.97 
 
 
209 aa  133  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  46.36 
 
 
196 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>