More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_3004 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  100 
 
 		 210 aa  417  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  48.31 
 
 		 222 aa  161  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  54.73 
 
 		 202 aa  160  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  53.02 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.02 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.88 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  45.83 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  48.57 
 
 		 204 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.66 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  48.8 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  46.02 
 
 		 187 aa  149  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  38.96 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  38.96 
 
 		 230 aa  148  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  44.64 
 
 		 207 aa  147  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  50.33 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  48.5 
 
 		 206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  46.01 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  43.33 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  50 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  48.34 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  47.02 
 
 		 205 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  47.55 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  47.59 
 
 		 203 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  41.97 
 
 		 201 aa  138  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  45.99 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  45.71 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14947  mitochondrial GrpE-like protein  41.21 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0088904  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  45.52 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  40.61 
 
 		 189 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  45.34 
 
 		 186 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  43.72 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  38.95 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  44.3 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  45.1 
 
 		 209 aa  124  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15032  predicted protein  42.11 
 
 		 157 aa  123  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189878  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  39.47 
 
 		 178 aa  123  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  38.95 
 
 		 178 aa  121  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  43.05 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  42.21 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  39.29 
 
 		 189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  39.58 
 
 		 186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  38.35 
 
 		 200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  44.81 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0208  GrpE protein  42.86 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2497  putative heat shock protein  40.85 
 
 		 182 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.437332 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  37.65 
 
 		 186 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  39.47 
 
 		 182 aa  118  7.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  43.33 
 
 		 204 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  41.5 
 
 		 194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2575  GrpE protein  41.83 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160939 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  37.24 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  39.6 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  38 
 
 		 193 aa  115  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1527  heat shock protein GrpE  40.36 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  34.56 
 
 		 201 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  42.96 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  41.55 
 
 		 202 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  43.79 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  36.32 
 
 		 206 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  36.32 
 
 		 206 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  36.32 
 
 		 206 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1970  GrpE protein  39.74 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000003831  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  36.32 
 
 		 206 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  41.13 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  41.56 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  36.18 
 
 		 206 aa  112  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  41.84 
 
 		 178 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  36.51 
 
 		 180 aa  111  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  37.2 
 
 		 205 aa  111  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  37.62 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  39.6 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  40.48 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0924  GrpE protein  41.84 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.929146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  38.93 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  36.9 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  41.13 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  41.13 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  41.13 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  35.33 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  41.13 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  41.13 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  41.13 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  39.72 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  39.72 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  39.72 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  41.13 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  39.72 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  39.72 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  38.93 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  37.31 
 
 		 194 aa  108  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  38.93 
 
 		 203 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  36.63 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  38.26 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  35.71 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  38.26 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2874  heat shock protein GrpE  41.18 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3643  GrpE protein  41.32 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2468  heat shock protein GrpE  41.18 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.338096  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2639  heat shock protein GrpE  41.91 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>