More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0383 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 202 aa  407  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  98.51 
 
 		 202 aa  400  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  86.63 
 
 		 202 aa  333  7e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  81.76 
 
 		 204 aa  268  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  83.67 
 
 		 207 aa  256  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  79.47 
 
 		 226 aa  249  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  57.36 
 
 		 204 aa  227  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  57.28 
 
 		 206 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.42 
 
 		 217 aa  218  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  64.2 
 
 		 222 aa  218  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  58.76 
 
 		 208 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  66.88 
 
 		 207 aa  214  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  65.81 
 
 		 206 aa  214  8e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  61.68 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  60.48 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  62.35 
 
 		 230 aa  211  4.9999999999999996e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  62.35 
 
 		 230 aa  211  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  62.94 
 
 		 187 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  62.91 
 
 		 210 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  65.77 
 
 		 206 aa  203  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  64 
 
 		 205 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  63.09 
 
 		 203 aa  197  6e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  55.76 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  60.27 
 
 		 201 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  64.49 
 
 		 197 aa  191  5e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  53.69 
 
 		 213 aa  165  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  53.06 
 
 		 210 aa  158  7e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  49.07 
 
 		 197 aa  142  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3643  GrpE protein  50 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  46.41 
 
 		 181 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  39.64 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  46 
 
 		 179 aa  137  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  50 
 
 		 181 aa  136  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  43.95 
 
 		 186 aa  135  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1974  GrpE protein  46.53 
 
 		 210 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.26677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  46.9 
 
 		 205 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  46.41 
 
 		 187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  46.94 
 
 		 189 aa  131  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  46.94 
 
 		 186 aa  130  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  38.02 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0208  GrpE protein  40.91 
 
 		 188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64096  predicted protein  43.23 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  0.0799005 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  44.9 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  41.67 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  40.88 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  40.88 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  40.88 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  40.88 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  40.99 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  40.62 
 
 		 206 aa  126  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  40.37 
 
 		 203 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1647  GrpE protein  41.95 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.165316  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15032  predicted protein  42 
 
 		 157 aa  125  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189878  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  41.72 
 
 		 181 aa  125  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  44.44 
 
 		 192 aa  125  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  41.56 
 
 		 204 aa  124  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  40.62 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  39.87 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  41.83 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14947  mitochondrial GrpE-like protein  37.99 
 
 		 240 aa  121  7e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0088904  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  42.59 
 
 		 209 aa  121  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  42.42 
 
 		 180 aa  121  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  41.67 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  37.24 
 
 		 218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  43.84 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  39.74 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  41.72 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  40.41 
 
 		 205 aa  117  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  41.82 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  43.4 
 
 		 184 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0800  heat shock protein GrpE  39.86 
 
 		 189 aa  114  8.999999999999998e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.200393  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  46.71 
 
 		 181 aa  114  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  38.96 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  43.31 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  38.65 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  36.07 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  42.95 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  43.59 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  37.65 
 
 		 210 aa  111  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  42.66 
 
 		 181 aa  111  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  43.66 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  40.74 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  41.26 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  36.36 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  43.26 
 
 		 198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  42.76 
 
 		 260 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  40.38 
 
 		 185 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0111  GrpE protein  33.13 
 
 		 199 aa  108  5e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  40.56 
 
 		 181 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  40.56 
 
 		 181 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  40.56 
 
 		 181 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  39.88 
 
 		 184 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  42.51 
 
 		 186 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  41.96 
 
 		 178 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  42.96 
 
 		 194 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  41.26 
 
 		 181 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  41.26 
 
 		 181 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  41.96 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  41.96 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>