More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3643 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3643  GrpE protein  100 
 
 		 221 aa  442  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  48.72 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.88 
 
 		 217 aa  148  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  45.51 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  45.51 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  47.02 
 
 		 222 aa  141  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  41.01 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  42.45 
 
 		 226 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  43.98 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  38.73 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  47.97 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.95 
 
 		 204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  43.14 
 
 		 210 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.58 
 
 		 207 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  42.48 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  45.68 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  41.83 
 
 		 187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  43.48 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  41.18 
 
 		 201 aa  126  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  42.77 
 
 		 181 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  41.56 
 
 		 206 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  42.07 
 
 		 205 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  41.67 
 
 		 181 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  45.71 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  43.38 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  41.22 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  41.51 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  42.14 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  39.13 
 
 		 210 aa  111  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  39.38 
 
 		 194 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  43.97 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  38.04 
 
 		 193 aa  109  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  42.55 
 
 		 181 aa  108  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0111  GrpE protein  37.06 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1537  molecular chaperone protein GrpE  42.03 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.818468  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  38.71 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0168  co-chaperone GrpE  33.17 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  37.23 
 
 		 189 aa  106  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  36.69 
 
 		 187 aa  106  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  40.15 
 
 		 198 aa  106  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  37.23 
 
 		 186 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  38.78 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  38.78 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  38.78 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  39.46 
 
 		 206 aa  105  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  38.78 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  38.93 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  35.29 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  35.53 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  39.44 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  40.65 
 
 		 184 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1974  GrpE protein  31.87 
 
 		 210 aa  102  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.26677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  39.16 
 
 		 201 aa  102  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  42.25 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  35 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  38.93 
 
 		 203 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  38.93 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  35.35 
 
 		 180 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  35.85 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  41.3 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  33.67 
 
 		 189 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  39.62 
 
 		 195 aa  99.8  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0800  heat shock protein GrpE  36.48 
 
 		 189 aa  99.4  4e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.200393  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  40.56 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  34.57 
 
 		 193 aa  99.4  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0924  GrpE protein  40.38 
 
 		 184 aa  99.4  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.929146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  36 
 
 		 184 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  38.26 
 
 		 203 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  35.85 
 
 		 185 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  39.01 
 
 		 189 aa  99  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  36.48 
 
 		 185 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  39.87 
 
 		 211 aa  98.2  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  37.66 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  39.57 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  39.44 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  36.88 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2292  GrpE protein  40 
 
 		 171 aa  96.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0174464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2666  co-chaperone GrpE  40 
 
 		 171 aa  96.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.832748  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15032  predicted protein  35.53 
 
 		 157 aa  96.3  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  35.19 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  40.43 
 
 		 181 aa  95.5  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  39.61 
 
 		 179 aa  95.1  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  37.09 
 
 		 179 aa  95.1  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 186 aa  95.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  35.67 
 
 		 200 aa  95.1  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  34.67 
 
 		 182 aa  95.1  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  35.37 
 
 		 184 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  37.59 
 
 		 189 aa  95.1  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  39.29 
 
 		 202 aa  95.1  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  39.72 
 
 		 181 aa  95.1  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  39.72 
 
 		 181 aa  95.1  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  39.72 
 
 		 181 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  39.72 
 
 		 181 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  39.26 
 
 		 195 aa  94.7  9e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  39.72 
 
 		 181 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  35.82 
 
 		 184 aa  94.4  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  36.18 
 
 		 195 aa  94  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2575  GrpE protein  37.13 
 
 		 181 aa  94.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>