More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1770 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  100 
 
 		 184 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  90.76 
 
 		 182 aa  335  1.9999999999999998e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  59.89 
 
 		 180 aa  211  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  68.57 
 
 		 181 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  68.57 
 
 		 181 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  68.57 
 
 		 181 aa  205  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  68.57 
 
 		 181 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2874  heat shock protein GrpE  70.9 
 
 		 215 aa  203  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  65.75 
 
 		 194 aa  203  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  67.14 
 
 		 181 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  67.14 
 
 		 181 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2468  heat shock protein GrpE  70.15 
 
 		 215 aa  200  9e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.338096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  65.71 
 
 		 181 aa  200  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  67.86 
 
 		 178 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2639  heat shock protein GrpE  70.15 
 
 		 214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  67.14 
 
 		 194 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  67.14 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  67.14 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  67.14 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  67.14 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  67.14 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  67.14 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  67.14 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  64.63 
 
 		 184 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  67.15 
 
 		 202 aa  195  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  55.19 
 
 		 178 aa  194  9e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  54.64 
 
 		 178 aa  192  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2497  putative heat shock protein  54.1 
 
 		 182 aa  191  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.437332 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  59.06 
 
 		 189 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  56.88 
 
 		 186 aa  181  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1527  heat shock protein GrpE  50.53 
 
 		 189 aa  180  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  50.54 
 
 		 181 aa  181  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  59.86 
 
 		 181 aa  180  9.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0924  GrpE protein  55.03 
 
 		 184 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.929146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  56.77 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1970  GrpE protein  50.54 
 
 		 187 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000003831  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2575  GrpE protein  58.39 
 
 		 181 aa  171  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160939 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  51.93 
 
 		 184 aa  170  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  56.2 
 
 		 207 aa  157  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  46.39 
 
 		 193 aa  156  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1537  molecular chaperone protein GrpE  56.3 
 
 		 173 aa  144  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.818468  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  48.73 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  48.05 
 
 		 209 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  48.94 
 
 		 205 aa  131  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  41.15 
 
 		 201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  44.19 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  43.04 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  43.81 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  43.81 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  45.45 
 
 		 209 aa  125  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  40.48 
 
 		 194 aa  124  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  45.45 
 
 		 201 aa  123  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  40.35 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  47.06 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 208 aa  121  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  47.33 
 
 		 206 aa  121  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  39.77 
 
 		 185 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  42.57 
 
 		 192 aa  121  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  42.44 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  46.67 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  42.11 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  40.36 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  43.87 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  45.77 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  47.33 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  39.27 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  43.6 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  44.59 
 
 		 195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  46.67 
 
 		 203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  46.67 
 
 		 206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  40.2 
 
 		 211 aa  117  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  45.33 
 
 		 206 aa  117  9e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  45.33 
 
 		 206 aa  117  9e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  45.33 
 
 		 206 aa  117  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  45.33 
 
 		 206 aa  117  9e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  39.6 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  40.24 
 
 		 187 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  43.87 
 
 		 240 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  39.8 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  43.05 
 
 		 228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  46.1 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  40.44 
 
 		 195 aa  114  5e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  41.03 
 
 		 190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  41.41 
 
 		 241 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.97 
 
 		 217 aa  114  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  40.35 
 
 		 184 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  41.41 
 
 		 196 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  41.41 
 
 		 250 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  41.41 
 
 		 196 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  40.52 
 
 		 181 aa  114  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  41.41 
 
 		 196 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  41.41 
 
 		 196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  41.41 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  41.41 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  41.41 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  41.41 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  41.41 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  43.71 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  41.41 
 
 		 197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  41.41 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>