More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2666 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2666  co-chaperone GrpE  100 
 
 		 171 aa  345  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.832748  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2292  GrpE protein  100 
 
 		 171 aa  345  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0174464 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  43.86 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  43.86 
 
 		 185 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  46.15 
 
 		 184 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  44.51 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  45.45 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  41.28 
 
 		 184 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  41.82 
 
 		 190 aa  121  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2497  putative heat shock protein  52.21 
 
 		 182 aa  120  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.437332 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  45.83 
 
 		 187 aa  120  9e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  42.31 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  44.79 
 
 		 193 aa  117  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  42.77 
 
 		 187 aa  117  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  41.76 
 
 		 189 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  43.05 
 
 		 189 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  45.45 
 
 		 189 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  39.88 
 
 		 186 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  43.26 
 
 		 210 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  41.77 
 
 		 245 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1537  molecular chaperone protein GrpE  48.18 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.818468  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  45.93 
 
 		 202 aa  114  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  42.41 
 
 		 210 aa  114  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  41.36 
 
 		 194 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  44.93 
 
 		 204 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  44.53 
 
 		 192 aa  114  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  44.53 
 
 		 192 aa  114  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  45.19 
 
 		 178 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  44.53 
 
 		 192 aa  114  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  43.36 
 
 		 200 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1970  GrpE protein  41.94 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000003831  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  44.44 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  45.19 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  45.65 
 
 		 211 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  45.19 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  45.19 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  44.37 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  45.19 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  45.19 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  45.19 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  45.19 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  45.19 
 
 		 194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  41.33 
 
 		 180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  45.19 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  45.19 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  45.19 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  45.19 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  40.11 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  45.19 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  45.19 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  43.71 
 
 		 187 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  50 
 
 		 226 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2468  heat shock protein GrpE  43.45 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.338096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  42.6 
 
 		 193 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2575  GrpE protein  39.02 
 
 		 181 aa  111  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160939 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  42.38 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0924  GrpE protein  42.96 
 
 		 184 aa  110  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.929146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  39.38 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  44.44 
 
 		 181 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  40.48 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  46.04 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2639  heat shock protein GrpE  42.07 
 
 		 214 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  44.29 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  43.07 
 
 		 195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  39.33 
 
 		 198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  41.06 
 
 		 181 aa  108  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  39.6 
 
 		 199 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2874  heat shock protein GrpE  43.45 
 
 		 215 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  43.07 
 
 		 195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  40.43 
 
 		 205 aa  107  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  37.58 
 
 		 179 aa  108  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  41.03 
 
 		 189 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  44.53 
 
 		 176 aa  107  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  42.22 
 
 		 195 aa  107  8.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  42.25 
 
 		 207 aa  107  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  42.45 
 
 		 198 aa  107  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  38.65 
 
 		 194 aa  107  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  42.34 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1527  heat shock protein GrpE  40.76 
 
 		 189 aa  106  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  43.8 
 
 		 195 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  41.13 
 
 		 206 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  44.44 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  45.21 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  37.86 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  40.4 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1259  heat shock protein GrpE  43.8 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.481119  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  40.43 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  36.91 
 
 		 212 aa  104  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  42.42 
 
 		 201 aa  104  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  35.85 
 
 		 180 aa  104  6e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  42.34 
 
 		 209 aa  103  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1090  co-chaperone GrpE  42.11 
 
 		 173 aa  104  8e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000331967  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  39.47 
 
 		 213 aa  103  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  39.07 
 
 		 184 aa  103  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  38.62 
 
 		 209 aa  103  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  37.77 
 
 		 190 aa  103  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  41.61 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  41.61 
 
 		 241 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  38.67 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  43.07 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>