More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2570 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  100 
 
 		 178 aa  354  2.9999999999999997e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  98.88 
 
 		 178 aa  349  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  81.22 
 
 		 181 aa  290  9e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  82.66 
 
 		 189 aa  287  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  86.27 
 
 		 181 aa  265  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  69.89 
 
 		 186 aa  261  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1527  heat shock protein GrpE  68.25 
 
 		 189 aa  250  8.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1970  GrpE protein  67.38 
 
 		 187 aa  241  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000003831  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2497  putative heat shock protein  68.36 
 
 		 182 aa  234  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.437332 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  71.15 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2575  GrpE protein  73.83 
 
 		 181 aa  214  5.9999999999999996e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160939 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  60.11 
 
 		 180 aa  203  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  66.01 
 
 		 194 aa  197  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  67.86 
 
 		 181 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  67.86 
 
 		 181 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  69.29 
 
 		 181 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  69.29 
 
 		 181 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  69.29 
 
 		 181 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  54.64 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  54.75 
 
 		 182 aa  191  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  67.86 
 
 		 181 aa  191  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  68.57 
 
 		 194 aa  190  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  69.34 
 
 		 202 aa  189  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  68.57 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  67.86 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  67.86 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  67.86 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  66.43 
 
 		 181 aa  187  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  67.86 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  67.86 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  67.86 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  67.86 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2874  heat shock protein GrpE  63.58 
 
 		 215 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  61.9 
 
 		 184 aa  182  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2468  heat shock protein GrpE  63.58 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.338096  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2639  heat shock protein GrpE  62.25 
 
 		 214 aa  176  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  57.59 
 
 		 207 aa  173  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0924  GrpE protein  52.35 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.929146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  47.98 
 
 		 184 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  51.03 
 
 		 193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1537  molecular chaperone protein GrpE  55.97 
 
 		 173 aa  142  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.818468  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  48.3 
 
 		 185 aa  136  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  44.94 
 
 		 187 aa  134  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  48.54 
 
 		 245 aa  131  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  46.41 
 
 		 210 aa  125  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  48.65 
 
 		 192 aa  124  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  42.86 
 
 		 218 aa  124  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  40.22 
 
 		 194 aa  123  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  47.41 
 
 		 194 aa  122  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  43.95 
 
 		 211 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  45.86 
 
 		 190 aa  123  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  39.78 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  38.95 
 
 		 210 aa  121  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  46.1 
 
 		 171 aa  121  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  48.28 
 
 		 184 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  47.41 
 
 		 204 aa  120  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  43.98 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  43.37 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.77 
 
 		 217 aa  118  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  47.02 
 
 		 240 aa  118  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  45.03 
 
 		 209 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  44.87 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  39.47 
 
 		 201 aa  117  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 		 186 aa  117  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  41.21 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  44.79 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  43.42 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  41.72 
 
 		 195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  42.42 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.86 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  45.86 
 
 		 222 aa  114  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  42.26 
 
 		 188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  42.22 
 
 		 189 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  42.44 
 
 		 200 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  42 
 
 		 199 aa  114  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  40.88 
 
 		 187 aa  114  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  38.86 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  38.99 
 
 		 198 aa  113  1.0000000000000001e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  41.11 
 
 		 189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  43.12 
 
 		 195 aa  113  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  42.76 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  43.84 
 
 		 199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  39.11 
 
 		 210 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  41.72 
 
 		 195 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  44.44 
 
 		 205 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2666  co-chaperone GrpE  40.11 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.832748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  45.51 
 
 		 228 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  45.03 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2292  GrpE protein  40.11 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0174464 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  40.61 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 		 195 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  43.7 
 
 		 189 aa  111  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  47.41 
 
 		 200 aa  111  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  43.9 
 
 		 230 aa  111  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  43.9 
 
 		 230 aa  111  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  45.19 
 
 		 187 aa  110  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  39.2 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1456  heat shock protein GrpE  42.76 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.022256  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1513  heat shock protein GrpE  42.76 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  43.59 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>