More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3125 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  100 
 
 		 186 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1527  heat shock protein GrpE  79.37 
 
 		 189 aa  303  7e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  69.89 
 
 		 178 aa  261  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  71.91 
 
 		 181 aa  258  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  70.43 
 
 		 178 aa  258  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  76.97 
 
 		 179 aa  246  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  68.33 
 
 		 189 aa  243  8e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1970  GrpE protein  68.62 
 
 		 187 aa  243  9e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000003831  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  72.55 
 
 		 181 aa  231  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2497  putative heat shock protein  64.09 
 
 		 182 aa  228  5e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.437332 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2575  GrpE protein  66.07 
 
 		 181 aa  217  7e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160939 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  63.76 
 
 		 194 aa  195  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  66.43 
 
 		 181 aa  192  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  65.71 
 
 		 194 aa  192  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  66.43 
 
 		 181 aa  192  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  66.43 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  66.42 
 
 		 202 aa  189  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  66.43 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  66.43 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  65 
 
 		 181 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  65 
 
 		 181 aa  187  9e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  59.38 
 
 		 180 aa  187  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  60.81 
 
 		 184 aa  184  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  63.57 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  56.44 
 
 		 182 aa  181  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  62.86 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  62.86 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  62.86 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  62.86 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  62.86 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  62.86 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  62.86 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  56.88 
 
 		 184 aa  181  7e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2468  heat shock protein GrpE  61.19 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.338096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2874  heat shock protein GrpE  61.19 
 
 		 215 aa  175  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2639  heat shock protein GrpE  61.19 
 
 		 214 aa  174  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0924  GrpE protein  50.82 
 
 		 184 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.929146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  55.06 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  50.28 
 
 		 184 aa  148  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1537  molecular chaperone protein GrpE  55.97 
 
 		 173 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.818468  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  51.09 
 
 		 193 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  49.7 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  48.04 
 
 		 187 aa  138  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  51.11 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  47.17 
 
 		 245 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  45.03 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  50.37 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  50.37 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  48.85 
 
 		 190 aa  128  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  44.1 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  45.12 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  51.11 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  46.95 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  45.12 
 
 		 209 aa  125  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  47.74 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  44.44 
 
 		 194 aa  122  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  43.71 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  45.81 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2292  GrpE protein  45.45 
 
 		 171 aa  122  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0174464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2666  co-chaperone GrpE  45.45 
 
 		 171 aa  122  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.832748  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  49.63 
 
 		 204 aa  121  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  50 
 
 		 192 aa  120  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  43.02 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  44.38 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  45.51 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  44.91 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  43.75 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  44.12 
 
 		 189 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  44.91 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  35.42 
 
 		 210 aa  118  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  44.31 
 
 		 206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  42.75 
 
 		 186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  44.31 
 
 		 206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  44.31 
 
 		 206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  44.31 
 
 		 206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  42.77 
 
 		 187 aa  117  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  43.27 
 
 		 210 aa  117  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  47.95 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  48.15 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  44.31 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  47.41 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  45.19 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  44.17 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  47.41 
 
 		 187 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  46.67 
 
 		 187 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  43.71 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  47.1 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  43.11 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  42.21 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  44.52 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  39.53 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  36.32 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  41.56 
 
 		 199 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  45.93 
 
 		 195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.51 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  40.1 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.67 
 
 		 202 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  41.06 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1513  heat shock protein GrpE  38.2 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>