More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1477 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  100 
 
 		 240 aa  478  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  52.5 
 
 		 218 aa  227  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  48.26 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  54.78 
 
 		 210 aa  178  8e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  54.61 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  50.31 
 
 		 193 aa  158  8e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  48.3 
 
 		 186 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  49.38 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  45.74 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  49.38 
 
 		 187 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  44.62 
 
 		 209 aa  148  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  43.96 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  48.62 
 
 		 189 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  46.2 
 
 		 184 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  45.68 
 
 		 211 aa  146  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  45.65 
 
 		 189 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  44.57 
 
 		 184 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  43 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  45.81 
 
 		 198 aa  143  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  45.61 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  45.61 
 
 		 185 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  46.5 
 
 		 206 aa  142  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  48.73 
 
 		 187 aa  141  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  42.86 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  44.05 
 
 		 201 aa  141  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  48.73 
 
 		 187 aa  141  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  45.22 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  46.79 
 
 		 212 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  45.86 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  46.5 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  45.86 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  46.71 
 
 		 199 aa  139  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  45.22 
 
 		 206 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  45.6 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  46.05 
 
 		 199 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  44.59 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  44.59 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  44.59 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  44.59 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  45.45 
 
 		 205 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  43.23 
 
 		 194 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  44.57 
 
 		 180 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  46 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  44.64 
 
 		 194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1537  molecular chaperone protein GrpE  52.14 
 
 		 173 aa  131  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.818468  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  48.63 
 
 		 184 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  47.68 
 
 		 193 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  45.74 
 
 		 184 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  38.73 
 
 		 209 aa  129  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0924  GrpE protein  48.7 
 
 		 184 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.929146  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2639  heat shock protein GrpE  44 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  43.59 
 
 		 190 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  42.38 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  41.67 
 
 		 195 aa  126  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  43.64 
 
 		 195 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  42.68 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  42.41 
 
 		 186 aa  125  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  46.31 
 
 		 194 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  42.26 
 
 		 195 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  43.84 
 
 		 192 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  44.29 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2468  heat shock protein GrpE  45.33 
 
 		 215 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.338096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  47.02 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  42.95 
 
 		 195 aa  122  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2874  heat shock protein GrpE  45.33 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  46.81 
 
 		 181 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  46.81 
 
 		 181 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  46.81 
 
 		 181 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  39.59 
 
 		 195 aa  121  8e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  46.81 
 
 		 181 aa  121  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  43.12 
 
 		 192 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  46.1 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  46.81 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  43.12 
 
 		 192 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  43.12 
 
 		 192 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  46.81 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  45.7 
 
 		 189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  46.1 
 
 		 185 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  46.1 
 
 		 185 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  46.1 
 
 		 185 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  46.1 
 
 		 185 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  46.1 
 
 		 185 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  46.1 
 
 		 181 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  46.1 
 
 		 185 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  37.13 
 
 		 260 aa  119  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  46.1 
 
 		 185 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  43.95 
 
 		 181 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  40.65 
 
 		 198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1527  heat shock protein GrpE  48.3 
 
 		 189 aa  118  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  44.22 
 
 		 179 aa  118  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  47.02 
 
 		 178 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  43.75 
 
 		 200 aa  118  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  47.95 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  46.27 
 
 		 202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  45.71 
 
 		 194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  47.02 
 
 		 178 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2575  GrpE protein  42.18 
 
 		 181 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160939 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  43.87 
 
 		 184 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  40.69 
 
 		 204 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  42.11 
 
 		 182 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>