More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01184 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  100 
 
 
172 aa  343  5e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1456  heat shock protein GrpE  80.81 
 
 
172 aa  289  1e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.022256  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1513  heat shock protein GrpE  80.81 
 
 
200 aa  288  2e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  69.82 
 
 
171 aa  232  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  56.06 
 
 
187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  52.59 
 
 
185 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  43.12 
 
 
189 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  45.7 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  46.31 
 
 
184 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  48.15 
 
 
210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  49.31 
 
 
190 aa  128  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  44.44 
 
 
187 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  44.44 
 
 
187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  41.71 
 
 
187 aa  127  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  47.22 
 
 
185 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  44.38 
 
 
186 aa  125  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  47.22 
 
 
185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  47.92 
 
 
184 aa  124  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  41.82 
 
 
189 aa  124  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  44.24 
 
 
210 aa  124  9e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  46.97 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  42.95 
 
 
184 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  45.75 
 
 
193 aa  117  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  41.32 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  44.85 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  36.14 
 
 
189 aa  116  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  42.11 
 
 
245 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  43.38 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  41.06 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  47.29 
 
 
186 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  37.57 
 
 
196 aa  114  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  44.12 
 
 
200 aa  114  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  40.37 
 
 
208 aa  114  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1537  molecular chaperone protein GrpE  51.16 
 
 
173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.818468  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  37.57 
 
 
197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  41.5 
 
 
198 aa  114  6.9999999999999995e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  37.57 
 
 
197 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  37.57 
 
 
197 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  37.57 
 
 
196 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  37.57 
 
 
197 aa  114  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  37.57 
 
 
197 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  37.57 
 
 
197 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  36.99 
 
 
197 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  44.62 
 
 
199 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  41.56 
 
 
192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  42.14 
 
 
198 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  41.56 
 
 
192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  41.56 
 
 
192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  45.86 
 
 
195 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  45.74 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  36.84 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  43.87 
 
 
206 aa  112  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  43.85 
 
 
199 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  44.7 
 
 
198 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  44.16 
 
 
201 aa  112  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  43.87 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  43.87 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  43.87 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  43.87 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  43.17 
 
 
192 aa  110  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  44.93 
 
 
203 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  43.94 
 
 
190 aa  110  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  42.75 
 
 
181 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  40.24 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  36.81 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  44.19 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  44.2 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  43.42 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  42.96 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  42.75 
 
 
181 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  36.72 
 
 
197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  38.26 
 
 
213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  44.52 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  43.07 
 
 
194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  44.03 
 
 
201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  43.94 
 
 
200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  44.2 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  44.93 
 
 
206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 
196 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  43.62 
 
 
181 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  43.48 
 
 
181 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 
250 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 
196 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  43.38 
 
 
204 aa  108  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 
196 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 
241 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  42.03 
 
 
181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0924  GrpE protein  45.74 
 
 
184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.929146  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  45.74 
 
 
193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  43.42 
 
 
178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  42.03 
 
 
181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  42.03 
 
 
181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  41.45 
 
 
194 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  32.72 
 
 
192 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  43.51 
 
 
189 aa  107  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  40.24 
 
 
195 aa  107  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0916  co-chaperone GrpE  38.96 
 
 
206 aa  107  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.764305  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  44.62 
 
 
200 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  32.58 
 
 
195 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  42.18 
 
 
179 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>