More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1527 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1527  heat shock protein GrpE  100 
 
 
189 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  79.37 
 
 
186 aa  303  7e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  68.25 
 
 
178 aa  250  9.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  68.25 
 
 
178 aa  248  5e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1970  GrpE protein  70 
 
 
187 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000003831  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  71.93 
 
 
181 aa  240  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2497  putative heat shock protein  68.82 
 
 
182 aa  238  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.437332 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  73.6 
 
 
179 aa  236  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  66.67 
 
 
189 aa  233  9e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  75.17 
 
 
181 aa  228  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2575  GrpE protein  68.26 
 
 
181 aa  211  5.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160939 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  67.86 
 
 
181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  67.86 
 
 
181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  67.14 
 
 
181 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  67.14 
 
 
181 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  67.14 
 
 
181 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  61.04 
 
 
184 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  63.76 
 
 
194 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  67.14 
 
 
181 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  60.23 
 
 
202 aa  189  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  65.71 
 
 
181 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  61.9 
 
 
180 aa  188  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  66.43 
 
 
178 aa  186  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  65.71 
 
 
185 aa  185  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  65.71 
 
 
185 aa  185  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  65.71 
 
 
185 aa  185  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  65.71 
 
 
185 aa  185  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  65.71 
 
 
185 aa  185  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  65.71 
 
 
185 aa  185  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  65.71 
 
 
185 aa  185  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  53.3 
 
 
182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  64.29 
 
 
194 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2874  heat shock protein GrpE  61.9 
 
 
215 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2468  heat shock protein GrpE  61.9 
 
 
215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.338096  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  50.53 
 
 
184 aa  180  9.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2639  heat shock protein GrpE  59.87 
 
 
214 aa  180  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0924  GrpE protein  54.4 
 
 
184 aa  176  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.929146  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  56.33 
 
 
207 aa  159  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  51.63 
 
 
184 aa  158  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1537  molecular chaperone protein GrpE  56.49 
 
 
173 aa  142  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.818468  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  47.8 
 
 
185 aa  136  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  49.25 
 
 
193 aa  137  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  48.41 
 
 
245 aa  131  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  50.34 
 
 
187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  48.51 
 
 
190 aa  127  7.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  47.74 
 
 
211 aa  122  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  43.86 
 
 
200 aa  122  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  42.31 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  44.24 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  40.41 
 
 
194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  47.06 
 
 
194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  50.38 
 
 
210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  48.59 
 
 
184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  48.3 
 
 
240 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  43.72 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  43.72 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  43.27 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  43.72 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  43.72 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  43.72 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  41.45 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  44.26 
 
 
203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  44.93 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  43.72 
 
 
206 aa  115  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  43.97 
 
 
205 aa  115  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  44.26 
 
 
206 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  38.07 
 
 
186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  41.44 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  48.2 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  43.86 
 
 
195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  43.72 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  40.36 
 
 
210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  44.22 
 
 
201 aa  115  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  44.65 
 
 
218 aa  114  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  43.17 
 
 
189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  42.21 
 
 
187 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  42.21 
 
 
187 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  46.67 
 
 
185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  46.67 
 
 
185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  44.22 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  39.34 
 
 
187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  46.67 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  50 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  42.96 
 
 
189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  47.1 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  47.89 
 
 
184 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  44.17 
 
 
198 aa  112  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  37.74 
 
 
230 aa  112  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  39.66 
 
 
200 aa  112  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  47.79 
 
 
195 aa  112  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  37.74 
 
 
230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  45.77 
 
 
171 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  44.17 
 
 
212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  44.08 
 
 
210 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  44.08 
 
 
210 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.74 
 
 
204 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  44.83 
 
 
210 aa  110  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  44.44 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  43.05 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  42.19 
 
 
190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>