More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0980 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  100 
 
 		 181 aa  355  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  81.22 
 
 		 178 aa  290  9e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  81.22 
 
 		 178 aa  286  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  78.31 
 
 		 189 aa  281  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  86 
 
 		 181 aa  259  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  71.91 
 
 		 186 aa  258  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1527  heat shock protein GrpE  71.93 
 
 		 189 aa  240  6e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1970  GrpE protein  67.91 
 
 		 187 aa  239  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000003831  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  73.72 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2575  GrpE protein  65.41 
 
 		 181 aa  222  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160939 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2497  putative heat shock protein  75.34 
 
 		 182 aa  222  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.437332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  68.46 
 
 		 194 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  57.87 
 
 		 180 aa  191  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  67.86 
 
 		 181 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  67.86 
 
 		 181 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  68.57 
 
 		 194 aa  188  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  68.57 
 
 		 181 aa  187  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  68.57 
 
 		 181 aa  187  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  68.57 
 
 		 181 aa  187  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  61.9 
 
 		 182 aa  184  7e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  68.61 
 
 		 202 aa  183  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  67.86 
 
 		 178 aa  183  9e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  66.43 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  65.71 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  67.14 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  67.14 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  67.14 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  67.14 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  67.14 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  67.14 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  67.14 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  54.64 
 
 		 184 aa  181  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  59.86 
 
 		 184 aa  180  9.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0924  GrpE protein  53.53 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.929146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2874  heat shock protein GrpE  60.26 
 
 		 215 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2468  heat shock protein GrpE  60.26 
 
 		 215 aa  171  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.338096  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2639  heat shock protein GrpE  58.94 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  54.84 
 
 		 207 aa  160  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  48.86 
 
 		 184 aa  155  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  51.72 
 
 		 193 aa  144  8.000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1537  molecular chaperone protein GrpE  55.97 
 
 		 173 aa  140  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.818468  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  44.83 
 
 		 218 aa  131  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  48.73 
 
 		 192 aa  127  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  46.34 
 
 		 245 aa  127  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  46.94 
 
 		 185 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  44.26 
 
 		 187 aa  124  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  47.44 
 
 		 184 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  44.94 
 
 		 194 aa  120  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  48.89 
 
 		 204 aa  120  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  43.33 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  46.31 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  42.55 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  44.81 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  46.9 
 
 		 185 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  46.9 
 
 		 185 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  41.32 
 
 		 194 aa  117  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.99 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  43.9 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  43.92 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  46.88 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.68 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  44.37 
 
 		 240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 		 189 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  46.71 
 
 		 202 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.71 
 
 		 202 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  43.71 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  42.04 
 
 		 198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  39.51 
 
 		 198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  42.33 
 
 		 200 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  42.6 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  44.32 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  43.59 
 
 		 171 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  45.77 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  46.31 
 
 		 226 aa  111  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  42.5 
 
 		 201 aa  111  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  45.39 
 
 		 222 aa  110  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  44.16 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  46.85 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  46.71 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  43.04 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  40.35 
 
 		 187 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  44.37 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.85 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  43.92 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  42.67 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2292  GrpE protein  41.06 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0174464 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2666  co-chaperone GrpE  41.06 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.832748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  43.23 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  43.42 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  40.52 
 
 		 189 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  42.77 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  45.19 
 
 		 187 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  38.12 
 
 		 195 aa  107  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 186 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  42.77 
 
 		 203 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  43.75 
 
 		 206 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  43.75 
 
 		 206 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  45.19 
 
 		 187 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  43.75 
 
 		 206 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>