More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1090 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1090  co-chaperone GrpE  100 
 
 
173 aa  347  5e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000331967  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  57.64 
 
 
180 aa  171  5e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  51.2 
 
 
179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  46.36 
 
 
186 aa  141  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1643  GrpE protein  49.66 
 
 
185 aa  141  5e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120336  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  45.2 
 
 
175 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1259  heat shock protein GrpE  47.31 
 
 
176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.481119  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  46.71 
 
 
176 aa  136  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1120  co-chaperone GrpE  50.37 
 
 
194 aa  135  4e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0675757  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  40.35 
 
 
185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  39.77 
 
 
185 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  43.84 
 
 
184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  41.78 
 
 
184 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  44.36 
 
 
185 aa  122  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0936  heat shock protein GrpE  48.15 
 
 
169 aa  120  7e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0941203  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  40.28 
 
 
189 aa  120  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  39.58 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  37.75 
 
 
186 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  38.41 
 
 
189 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  39.58 
 
 
187 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  38.89 
 
 
187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  44.85 
 
 
200 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  42.36 
 
 
212 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  41.43 
 
 
201 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  42.65 
 
 
204 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  41.38 
 
 
201 aa  111  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  39.71 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  41.18 
 
 
178 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  41.18 
 
 
211 aa  108  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  39.39 
 
 
198 aa  108  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  41.18 
 
 
209 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  41.91 
 
 
198 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  35.62 
 
 
186 aa  107  9.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  40.44 
 
 
185 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  40.44 
 
 
185 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  40.44 
 
 
185 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  40.44 
 
 
185 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  40.44 
 
 
185 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  40.44 
 
 
185 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  40.44 
 
 
185 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  40.44 
 
 
190 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1456  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 
172 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.022256  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  33.71 
 
 
195 aa  106  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  40.6 
 
 
210 aa  106  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1513  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 
200 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  42.65 
 
 
181 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  42.65 
 
 
181 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.23 
 
 
189 aa  106  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  42.65 
 
 
181 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  42.65 
 
 
181 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  35.03 
 
 
190 aa  105  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  38.93 
 
 
192 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  38.93 
 
 
192 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  38.93 
 
 
192 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2874  heat shock protein GrpE  42.54 
 
 
215 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  38.36 
 
 
172 aa  105  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  38.35 
 
 
199 aa  105  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2468  heat shock protein GrpE  42.54 
 
 
215 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.338096  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  40.44 
 
 
181 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  40.44 
 
 
181 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  40 
 
 
171 aa  104  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  41.48 
 
 
194 aa  104  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  40.15 
 
 
188 aa  104  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  39.39 
 
 
187 aa  104  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2292  GrpE protein  42.11 
 
 
171 aa  104  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0174464 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 
180 aa  103  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2666  co-chaperone GrpE  42.11 
 
 
171 aa  104  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.832748  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  36.05 
 
 
210 aa  103  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  32.77 
 
 
195 aa  103  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  40.74 
 
 
202 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  36.69 
 
 
245 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  40.74 
 
 
194 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  38.24 
 
 
209 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  39.71 
 
 
181 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  41.3 
 
 
194 aa  102  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  39.1 
 
 
198 aa  102  4e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  40.3 
 
 
195 aa  101  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  38.64 
 
 
186 aa  101  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  38.24 
 
 
200 aa  100  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  39.42 
 
 
217 aa  100  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  41.96 
 
 
193 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  34.33 
 
 
189 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  41.98 
 
 
195 aa  100  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  34.84 
 
 
208 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  41.79 
 
 
210 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 
200 aa  99  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  34.19 
 
 
208 aa  99  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  35.07 
 
 
192 aa  99  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2639  heat shock protein GrpE  40.3 
 
 
214 aa  98.6  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  38.1 
 
 
184 aa  98.6  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  38.97 
 
 
203 aa  98.6  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  38.24 
 
 
206 aa  97.8  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  41.22 
 
 
184 aa  97.8  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  39.1 
 
 
186 aa  97.8  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  36.76 
 
 
200 aa  98.2  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1537  molecular chaperone protein GrpE  38.52 
 
 
173 aa  96.7  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.818468  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  37.88 
 
 
179 aa  97.1  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1527  heat shock protein GrpE  40.15 
 
 
189 aa  96.7  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  38.24 
 
 
206 aa  97.1  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>