More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2045 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  100 
 
 		 180 aa  362  1e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  77.22 
 
 		 179 aa  288  4e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1090  co-chaperone GrpE  57.64 
 
 		 173 aa  171  5.999999999999999e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000331967  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  57.58 
 
 		 175 aa  168  4e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  49.73 
 
 		 186 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  55.48 
 
 		 176 aa  160  9e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1259  heat shock protein GrpE  48.88 
 
 		 176 aa  156  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.481119  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1643  GrpE protein  50.68 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120336  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1120  co-chaperone GrpE  51.02 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0675757  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0936  heat shock protein GrpE  53.74 
 
 		 169 aa  144  5e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0941203  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  39.04 
 
 		 181 aa  114  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  44.29 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  41.04 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  35.06 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.67 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  35.81 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  38.2 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  38.73 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  36.6 
 
 		 184 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 		 182 aa  108  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  41.67 
 
 		 190 aa  109  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  40.44 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  35.14 
 
 		 185 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  35.52 
 
 		 192 aa  107  7.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  35.95 
 
 		 184 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  36.49 
 
 		 189 aa  107  8.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  37.99 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  33.15 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  44.2 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  42.18 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 228 aa  104  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  38.52 
 
 		 189 aa  104  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2666  co-chaperone GrpE  35.85 
 
 		 171 aa  104  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.832748  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2292  GrpE protein  35.85 
 
 		 171 aa  104  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0174464 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  38.78 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.35 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  38.26 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  39.89 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  38.99 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  39.6 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  38.41 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  40.27 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  34.23 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  35.26 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  33.7 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  38.89 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  39.74 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  34.59 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 241 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 250 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  35.33 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  38.78 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0924  GrpE protein  38.73 
 
 		 184 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.929146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.44 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  36.21 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  36.26 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 196 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  33.56 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 196 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 196 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  35.1 
 
 		 198 aa  101  5e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  38.1 
 
 		 208 aa  101  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  33.78 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  35.33 
 
 		 208 aa  101  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2497  putative heat shock protein  37.95 
 
 		 182 aa  100  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.437332 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  35.1 
 
 		 197 aa  100  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  39.33 
 
 		 195 aa  100  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  37.67 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  33.78 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  37.67 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1527  heat shock protein GrpE  36.9 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  37.75 
 
 		 210 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  36.67 
 
 		 180 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  36.91 
 
 		 213 aa  99  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 		 230 aa  99.4  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 		 230 aa  99  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  38.1 
 
 		 197 aa  99  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  34.13 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  39.71 
 
 		 199 aa  99  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  35.48 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  37.75 
 
 		 210 aa  99  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  41.04 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  38.41 
 
 		 200 aa  98.6  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  35.1 
 
 		 195 aa  99  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  31.84 
 
 		 189 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  36.84 
 
 		 202 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  37.16 
 
 		 194 aa  98.6  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  39.35 
 
 		 197 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  37.42 
 
 		 197 aa  98.2  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  36.84 
 
 		 202 aa  97.8  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  36.25 
 
 		 188 aa  97.8  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  38.81 
 
 		 205 aa  97.8  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  41.01 
 
 		 181 aa  97.8  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  41.01 
 
 		 181 aa  97.8  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  38.56 
 
 		 201 aa  97.4  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  38.71 
 
 		 197 aa  97.4  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  38.71 
 
 		 196 aa  97.4  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  38.71 
 
 		 197 aa  97.4  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  38.71 
 
 		 197 aa  97.4  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>