More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2372 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2372  GrpE protein  100 
 
 
201 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.919254  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2457  GrpE protein  69.74 
 
 
204 aa  273  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.23302  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2133  HSP70 family protein GrpE  65.83 
 
 
199 aa  265  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0603928  normal  0.40294 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  44.78 
 
 
200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  49.66 
 
 
211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  55.03 
 
 
210 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  41.79 
 
 
200 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  40.8 
 
 
201 aa  142  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  43.67 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  40.8 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  49.03 
 
 
209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  43.56 
 
 
206 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  43.56 
 
 
206 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  43.56 
 
 
206 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  43.56 
 
 
206 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  48.39 
 
 
206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  49.03 
 
 
203 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  48.39 
 
 
206 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  44.17 
 
 
201 aa  138  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  44.59 
 
 
212 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  52.21 
 
 
204 aa  136  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  48.39 
 
 
203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 
206 aa  135  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  46.45 
 
 
194 aa  135  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  50 
 
 
205 aa  135  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  39.62 
 
 
200 aa  134  8e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  44.72 
 
 
209 aa  133  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  51.43 
 
 
192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  47.65 
 
 
184 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  42.16 
 
 
194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  43.93 
 
 
195 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  41.01 
 
 
189 aa  129  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  47.3 
 
 
185 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  46.62 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  43.27 
 
 
195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  42.77 
 
 
195 aa  124  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  46.31 
 
 
184 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  39.13 
 
 
195 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  41.34 
 
 
186 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  44.74 
 
 
192 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  44.74 
 
 
192 aa  122  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  44.74 
 
 
192 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  44.74 
 
 
190 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  44.97 
 
 
189 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  47.33 
 
 
210 aa  118  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0916  co-chaperone GrpE  46.21 
 
 
206 aa  118  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.764305  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  43.51 
 
 
195 aa  117  7.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  43.62 
 
 
187 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  41.89 
 
 
187 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  47.33 
 
 
185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  41.89 
 
 
187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  41.36 
 
 
186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  43.51 
 
 
196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  37.68 
 
 
197 aa  115  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  43.79 
 
 
250 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  43.51 
 
 
196 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  37.2 
 
 
197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  43.79 
 
 
241 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  37.2 
 
 
197 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  37.2 
 
 
197 aa  114  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  37.2 
 
 
197 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  37.2 
 
 
197 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  37.2 
 
 
197 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  43.79 
 
 
196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  40.91 
 
 
193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  43.79 
 
 
196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  43.79 
 
 
196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  40.44 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  48.09 
 
 
187 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  42.11 
 
 
198 aa  112  3e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  42.86 
 
 
245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  39.62 
 
 
213 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  39.66 
 
 
189 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  40.27 
 
 
208 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  41.06 
 
 
210 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  38.82 
 
 
228 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1974  GrpE protein  32.76 
 
 
210 aa  106  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.26677  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  39.04 
 
 
207 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  42.38 
 
 
184 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.82 
 
 
217 aa  105  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  39.58 
 
 
203 aa  105  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  40 
 
 
181 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2575  GrpE protein  43.92 
 
 
181 aa  105  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160939 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  41.54 
 
 
190 aa  104  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  39.58 
 
 
197 aa  104  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 
230 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 
230 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  36.9 
 
 
190 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  43.51 
 
 
218 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  38.19 
 
 
206 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  42.54 
 
 
199 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  38.97 
 
 
208 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.16 
 
 
204 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  42.54 
 
 
199 aa  101  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  38.24 
 
 
204 aa  101  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  36.99 
 
 
206 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  42.28 
 
 
205 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  42.42 
 
 
189 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  40.43 
 
 
222 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  37.18 
 
 
194 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>