More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2874 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  100 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  70.18 
 
 		 186 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  69.01 
 
 		 189 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  66.85 
 
 		 186 aa  237  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  73.38 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0208  GrpE protein  69.93 
 
 		 188 aa  228  5e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  66.67 
 
 		 197 aa  222  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  46.31 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  40.8 
 
 		 204 aa  134  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.95 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  41.67 
 
 		 210 aa  131  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  44.3 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.9 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  44.9 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  42.68 
 
 		 210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  40.99 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  43.84 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  42.5 
 
 		 222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.95 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  43.71 
 
 		 207 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  42.57 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.96 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 		 206 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  42.38 
 
 		 206 aa  121  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  43.79 
 
 		 203 aa  121  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  43.54 
 
 		 197 aa  121  7e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  41.77 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  40.88 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  41.4 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  40.88 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  40.51 
 
 		 205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  38.51 
 
 		 208 aa  117  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  39.49 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0401  GrpE protein  41.55 
 
 		 178 aa  114  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.465525 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  36.93 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  40.88 
 
 		 210 aa  113  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  39.29 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  40.44 
 
 		 189 aa  112  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  40.52 
 
 		 201 aa  108  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  36.36 
 
 		 204 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  38.96 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  40.88 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  37.25 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  36.91 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  38 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  35.71 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  39.57 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  33.88 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  35.85 
 
 		 205 aa  104  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  39.87 
 
 		 201 aa  104  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  36.54 
 
 		 186 aa  104  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  40.15 
 
 		 199 aa  104  9e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  41.18 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  37.59 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  39.42 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  35.57 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 		 178 aa  102  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  37.14 
 
 		 193 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 		 178 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  34.97 
 
 		 190 aa  101  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  36.26 
 
 		 173 aa  101  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  37.24 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  38.69 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  32.08 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  35.47 
 
 		 171 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  36.05 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  39.16 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  32.89 
 
 		 176 aa  99.8  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  34.22 
 
 		 209 aa  99  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  36.76 
 
 		 186 aa  99  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  38.57 
 
 		 200 aa  99.4  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  41.01 
 
 		 181 aa  99  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  38.93 
 
 		 195 aa  99.4  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14947  mitochondrial GrpE-like protein  35.22 
 
 		 240 aa  99  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0088904  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  34.76 
 
 		 209 aa  98.6  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1513  heat shock protein GrpE  33.7 
 
 		 200 aa  98.6  5e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  37.93 
 
 		 205 aa  98.6  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  35.14 
 
 		 198 aa  97.8  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  36.69 
 
 		 212 aa  97.8  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  36.69 
 
 		 199 aa  97.8  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  34.78 
 
 		 195 aa  97.1  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1259  heat shock protein GrpE  32.24 
 
 		 176 aa  97.4  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.481119  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  36.49 
 
 		 200 aa  97.1  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  32.95 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1456  heat shock protein GrpE  34.13 
 
 		 172 aa  96.7  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.022256  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  34.83 
 
 		 189 aa  96.3  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  37.06 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  32.52 
 
 		 206 aa  95.9  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64096  predicted protein  31.33 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  0.0799005 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15032  predicted protein  35.95 
 
 		 157 aa  95.5  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189878  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  33.33 
 
 		 194 aa  95.5  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  33.56 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  34.87 
 
 		 179 aa  95.1  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>