More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2924 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  100 
 
 		 173 aa  355  1.9999999999999998e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  42.75 
 
 		 198 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  43.08 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  40.27 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  40.27 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  37.97 
 
 		 181 aa  114  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  37.5 
 
 		 190 aa  114  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  36.14 
 
 		 188 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  35.71 
 
 		 181 aa  114  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  37.08 
 
 		 200 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  36.14 
 
 		 188 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  36.14 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  36.14 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  36.14 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  36.14 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  36.14 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  41.79 
 
 		 208 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  36.49 
 
 		 217 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  40.74 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  38.82 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  41.61 
 
 		 198 aa  111  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  35.54 
 
 		 188 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  43.94 
 
 		 244 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  37.04 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  34.3 
 
 		 204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  39.31 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4329  GrpE protein  45.38 
 
 		 242 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.134987  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  35.33 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  35.95 
 
 		 197 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  40.54 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  39.24 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  35.4 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  40.71 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 192 aa  104  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  37.65 
 
 		 181 aa  104  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0208  GrpE protein  35.71 
 
 		 188 aa  104  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  35.86 
 
 		 202 aa  104  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2639  heat shock protein GrpE  41.5 
 
 		 214 aa  103  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  36.6 
 
 		 181 aa  103  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  35.17 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  35.17 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 		 228 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  36.91 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2468  heat shock protein GrpE  40.82 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.338096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  38.96 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  41.48 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  38.31 
 
 		 207 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  38.51 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  38.3 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  34.68 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  37.23 
 
 		 213 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  36.81 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  36.09 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  38.69 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  34.44 
 
 		 210 aa  101  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  35.64 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  33.33 
 
 		 189 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  34.13 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  36.09 
 
 		 198 aa  101  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  35.96 
 
 		 187 aa  101  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  38.16 
 
 		 201 aa  101  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  33.54 
 
 		 210 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  39.62 
 
 		 206 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  37.91 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  39.26 
 
 		 200 aa  100  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  38.52 
 
 		 189 aa  100  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  34.32 
 
 		 210 aa  100  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  33.96 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  33.33 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2874  heat shock protein GrpE  40.14 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  34.06 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  34.81 
 
 		 230 aa  99.8  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  34.27 
 
 		 209 aa  99  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  34.73 
 
 		 204 aa  98.6  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  35.62 
 
 		 203 aa  98.6  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  35.9 
 
 		 192 aa  98.6  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  35.9 
 
 		 192 aa  98.6  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  37.67 
 
 		 231 aa  98.6  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  35.9 
 
 		 192 aa  98.6  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  32.56 
 
 		 172 aa  98.6  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  37.24 
 
 		 213 aa  98.2  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  38.96 
 
 		 204 aa  98.2  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  30.61 
 
 		 186 aa  98.2  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  34.18 
 
 		 230 aa  97.8  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 206 aa  97.4  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  34.36 
 
 		 211 aa  97.4  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  39.16 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  34.53 
 
 		 225 aa  96.3  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  34.01 
 
 		 206 aa  96.3  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  35.34 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  34.69 
 
 		 206 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  35.62 
 
 		 194 aa  95.5  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  34.18 
 
 		 222 aa  95.9  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  35.17 
 
 		 208 aa  95.5  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  34.52 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  36.81 
 
 		 192 aa  95.5  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  34.48 
 
 		 195 aa  95.9  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  36.31 
 
 		 199 aa  95.1  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 		 200 aa  95.1  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>