More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0002 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  100 
 
 
206 aa  407  1e-113  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  41.08 
 
 
179 aa  114  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  36.07 
 
 
194 aa  111  6e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  37.78 
 
 
186 aa  111  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  41.94 
 
 
185 aa  111  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  41.61 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  37.04 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  36.31 
 
 
190 aa  108  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  31.09 
 
 
200 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  32.99 
 
 
194 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  39.46 
 
 
204 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  36.99 
 
 
226 aa  106  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  37.04 
 
 
210 aa  105  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0627  co-chaperone protein GrpE  35.61 
 
 
247 aa  105  6e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0327836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  36.09 
 
 
206 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  38.12 
 
 
172 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  40.29 
 
 
198 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  38.25 
 
 
195 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  36.31 
 
 
213 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  36.05 
 
 
210 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  34.25 
 
 
188 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  34.25 
 
 
188 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  34.25 
 
 
188 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  35.12 
 
 
213 aa  102  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  34.25 
 
 
188 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  35.63 
 
 
187 aa  102  3e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  34.25 
 
 
188 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  38.12 
 
 
172 aa  102  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  35.71 
 
 
192 aa  102  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  38.82 
 
 
189 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  34.25 
 
 
188 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  31.9 
 
 
282 aa  102  5e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  34.25 
 
 
188 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  34.25 
 
 
188 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  37.65 
 
 
181 aa  101  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_002620  TC0674  grpE protein  34.52 
 
 
190 aa  100  1e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.04297  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  31.49 
 
 
199 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5051  GrpE protein  41.33 
 
 
192 aa  100  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845613  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  32.39 
 
 
206 aa  100  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1692  GrpE protein  34.13 
 
 
209 aa  99.8  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.347105  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0853  GrpE protein  34.24 
 
 
188 aa  99.8  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000644749  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  31.63 
 
 
199 aa  99.4  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  38.82 
 
 
213 aa  99  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  34.34 
 
 
208 aa  99.4  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  35.71 
 
 
192 aa  99  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  34.34 
 
 
208 aa  99.4  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  37 
 
 
231 aa  99  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  32.49 
 
 
201 aa  98.6  6e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1488  GrpE protein  33.33 
 
 
198 aa  98.2  7e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  34.3 
 
 
190 aa  98.2  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  33.16 
 
 
217 aa  97.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  34.1 
 
 
172 aa  97.8  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  38.99 
 
 
201 aa  97.8  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  34.27 
 
 
197 aa  97.1  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  32.35 
 
 
187 aa  97.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1456  heat shock protein GrpE  35.26 
 
 
172 aa  97.4  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.022256  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1513  heat shock protein GrpE  35.26 
 
 
200 aa  97.4  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  34.43 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  32.69 
 
 
192 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  37.25 
 
 
205 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08251  GrpE protein (Hsp-70 cofactor)  39.33 
 
 
191 aa  95.9  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.643992  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  32.93 
 
 
175 aa  95.9  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  32.89 
 
 
192 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  38.99 
 
 
286 aa  95.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  35 
 
 
223 aa  95.1  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  31.61 
 
 
202 aa  95.1  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  32.69 
 
 
198 aa  95.1  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  36.41 
 
 
192 aa  94.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  36.41 
 
 
192 aa  94.7  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  36.41 
 
 
192 aa  94.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  33.94 
 
 
204 aa  94.7  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  33.51 
 
 
209 aa  94.7  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  34.84 
 
 
212 aa  94.7  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  34.95 
 
 
186 aa  94  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  36.47 
 
 
248 aa  93.2  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0978  hypothetical protein  35.37 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.115351 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  32.93 
 
 
204 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  32.69 
 
 
224 aa  92.8  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  36.67 
 
 
209 aa  92.8  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  33.67 
 
 
200 aa  92.8  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1605  GrpE protein  32.69 
 
 
162 aa  92.4  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0303276  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  35.14 
 
 
187 aa  92.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  29.94 
 
 
210 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  28.74 
 
 
178 aa  92  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  35.56 
 
 
175 aa  91.7  6e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  32.92 
 
 
230 aa  91.7  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  32.92 
 
 
230 aa  91.7  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  30.67 
 
 
191 aa  91.7  8e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  30.94 
 
 
180 aa  91.3  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  35.2 
 
 
206 aa  91.3  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  32.04 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  31.43 
 
 
173 aa  90.9  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  33.33 
 
 
208 aa  90.5  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  30.56 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  36.25 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  33.91 
 
 
181 aa  91.3  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  34.46 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  32.62 
 
 
183 aa  90.1  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  36.3 
 
 
171 aa  90.1  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  35.63 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>