More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0401 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0401  GrpE protein  100 
 
 		 178 aa  346  1e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.465525 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  41.55 
 
 		 187 aa  114  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  39.11 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  42.66 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  38.25 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  38.99 
 
 		 197 aa  98.6  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  37.14 
 
 		 197 aa  95.5  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.28 
 
 		 217 aa  94.7  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  38.36 
 
 		 213 aa  93.6  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  38.78 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0208  GrpE protein  38.73 
 
 		 188 aa  92.4  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  37.41 
 
 		 202 aa  92  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  34.95 
 
 		 202 aa  91.3  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  39.86 
 
 		 181 aa  90.9  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  36.18 
 
 		 210 aa  90.9  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.1 
 
 		 202 aa  90.9  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 		 212 aa  90.9  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  38.52 
 
 		 199 aa  90.1  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  36.41 
 
 		 203 aa  90.5  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  37.78 
 
 		 199 aa  89  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  39.44 
 
 		 205 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  39.01 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  36.17 
 
 		 206 aa  88.2  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  35.77 
 
 		 211 aa  87.8  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  35.26 
 
 		 206 aa  87.8  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  35.52 
 
 		 187 aa  87.4  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  37.42 
 
 		 207 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 		 200 aa  85.1  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  40.15 
 
 		 178 aa  85.1  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  40.15 
 
 		 178 aa  84.7  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  38.26 
 
 		 194 aa  84.7  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  36.96 
 
 		 210 aa  84.7  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  39.86 
 
 		 228 aa  84.3  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  36.05 
 
 		 204 aa  84.3  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  33.33 
 
 		 201 aa  84  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  33.58 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  30.5 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  34.62 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  30.41 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  33.52 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  31.39 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  37.32 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  32.85 
 
 		 241 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  37.32 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  32.14 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  32.85 
 
 		 250 aa  81.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  38.41 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  33.1 
 
 		 217 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  35.25 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  32.85 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  32.85 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  32.14 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  32.85 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  34.33 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  33.58 
 
 		 203 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  36.17 
 
 		 205 aa  80.9  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  38.69 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  38.03 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  32.86 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  32.14 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  32.12 
 
 		 174 aa  80.9  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  33.58 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  34.46 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  33.58 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  31.43 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  32.85 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  35.56 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  37.32 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  34.69 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  33.81 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  33.81 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2666  co-chaperone GrpE  34.55 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.832748  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  32.12 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  32.35 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2292  GrpE protein  34.55 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0174464 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  32.12 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  32.12 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  32.85 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  32.12 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  32.12 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  32.12 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  32.12 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  32.12 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  35.29 
 
 		 260 aa  78.2  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  32.12 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  28.75 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  30.43 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  31.28 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  33.33 
 
 		 207 aa  77.8  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  35.77 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  33.57 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  34.01 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>