More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2881 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  100 
 
 		 181 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  51.83 
 
 		 195 aa  179  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  54.96 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  49.23 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2165  GrpE protein  47.01 
 
 		 191 aa  136  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.281053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  42.07 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  50.76 
 
 		 198 aa  131  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  40.12 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  42.39 
 
 		 181 aa  123  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  40.74 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  44.7 
 
 		 189 aa  117  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  41.03 
 
 		 213 aa  118  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  41.84 
 
 		 213 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  43.28 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  41.13 
 
 		 208 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  39.13 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  40.74 
 
 		 188 aa  111  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  38.36 
 
 		 185 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  38.36 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  38.12 
 
 		 178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  37.14 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  38.41 
 
 		 201 aa  108  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  40.44 
 
 		 184 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  39.58 
 
 		 195 aa  107  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  41.22 
 
 		 199 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  36.05 
 
 		 181 aa  107  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  40.44 
 
 		 184 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  39.69 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  39.39 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  35.08 
 
 		 201 aa  106  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  39.38 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  41.79 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  38.82 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  37.65 
 
 		 173 aa  104  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  36.36 
 
 		 245 aa  104  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  38.89 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  36.67 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  36.67 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  36.67 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  36.67 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  36.67 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  35.12 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  37.59 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  37.33 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  37.33 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  39.29 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  36.67 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  36.25 
 
 		 194 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  36.67 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  36.67 
 
 		 198 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  41.3 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  41.72 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  38.07 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  39.51 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  37.75 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  38.41 
 
 		 206 aa  101  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  38.41 
 
 		 206 aa  101  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  38.41 
 
 		 206 aa  101  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  38.41 
 
 		 206 aa  101  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  39.07 
 
 		 206 aa  101  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  39.23 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  34.5 
 
 		 189 aa  101  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  36.32 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  39.33 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  36.32 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 		 203 aa  101  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  36.32 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  32.96 
 
 		 181 aa  100  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  35.59 
 
 		 225 aa  100  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  37.32 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  40.15 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  37.59 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  34.87 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  35.38 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  35.57 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  37.76 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  35.38 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  36.93 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  35.38 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  34.67 
 
 		 210 aa  99.8  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  35.38 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  35.38 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  35.38 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  35.38 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  34.62 
 
 		 187 aa  99.8  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  35.38 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  39.39 
 
 		 192 aa  99.4  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  36.93 
 
 		 203 aa  98.6  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  40.91 
 
 		 195 aa  98.6  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  34.87 
 
 		 199 aa  98.2  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  34.24 
 
 		 181 aa  98.2  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  34.71 
 
 		 260 aa  98.2  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  35.09 
 
 		 189 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  34.04 
 
 		 190 aa  97.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  36.76 
 
 		 209 aa  97.1  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  37.5 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1456  heat shock protein GrpE  39.16 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.022256  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1513  heat shock protein GrpE  39.16 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>