More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0016 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  100 
 
 
174 aa  344  3e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  42.86 
 
 
198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  40 
 
 
194 aa  117  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  40 
 
 
213 aa  117  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  38.41 
 
 
225 aa  116  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  42.11 
 
 
189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  39.57 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  39.86 
 
 
213 aa  111  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  40.13 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  40.15 
 
 
208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  37.14 
 
 
198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  41.98 
 
 
191 aa  108  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  39.39 
 
 
181 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  42.75 
 
 
172 aa  105  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  42.36 
 
 
172 aa  106  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  34.23 
 
 
217 aa  104  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  41.35 
 
 
221 aa  104  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  37.41 
 
 
181 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  35.07 
 
 
195 aa  101  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  40.74 
 
 
190 aa  101  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1605  GrpE protein  35.71 
 
 
162 aa  100  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0303276  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  35.82 
 
 
192 aa  99.4  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  34.78 
 
 
198 aa  99  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  34.06 
 
 
192 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  34.06 
 
 
192 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  34.06 
 
 
188 aa  98.6  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  34.06 
 
 
188 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  34.06 
 
 
188 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  34.06 
 
 
188 aa  97.8  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  34.06 
 
 
188 aa  97.8  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  34.06 
 
 
188 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  34.06 
 
 
188 aa  97.8  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  34.06 
 
 
188 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  40.77 
 
 
195 aa  97.4  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  35.34 
 
 
173 aa  97.1  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  38.06 
 
 
209 aa  96.7  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  31.64 
 
 
181 aa  96.7  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  37.21 
 
 
207 aa  96.7  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  31.94 
 
 
193 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  34.01 
 
 
201 aa  96.3  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  36.88 
 
 
181 aa  95.9  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  36.84 
 
 
187 aa  95.9  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  35.67 
 
 
178 aa  95.9  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  35.38 
 
 
201 aa  95.5  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  33.58 
 
 
185 aa  94.7  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  38.41 
 
 
207 aa  94.7  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  39.13 
 
 
188 aa  95.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  36.76 
 
 
181 aa  94.4  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  36.55 
 
 
204 aa  93.6  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  37.68 
 
 
186 aa  92.8  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1347  GrpE protein  36.69 
 
 
150 aa  92.8  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.966336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  38.35 
 
 
246 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 
225 aa  93.2  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  37.68 
 
 
206 aa  93.2  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  36.81 
 
 
242 aa  92.8  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  39.1 
 
 
231 aa  92  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  33.82 
 
 
224 aa  92  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  35.34 
 
 
224 aa  91.7  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  38.97 
 
 
199 aa  91.3  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1459  GrpE protein  36.76 
 
 
184 aa  91.3  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  36.09 
 
 
223 aa  90.9  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  36.09 
 
 
239 aa  90.5  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  35.71 
 
 
208 aa  90.5  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  36.3 
 
 
274 aa  90.5  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  35.71 
 
 
208 aa  90.5  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  36.15 
 
 
175 aa  90.1  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  34.35 
 
 
184 aa  90.1  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  35.14 
 
 
226 aa  89.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  36.69 
 
 
206 aa  89.4  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  31.39 
 
 
179 aa  89.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  32.14 
 
 
260 aa  89.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  35.61 
 
 
204 aa  89.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  33.08 
 
 
187 aa  89.4  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  32.43 
 
 
210 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  33.11 
 
 
210 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  34.31 
 
 
180 aa  89  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0564  GrpE protein  34.35 
 
 
211 aa  89  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  38.24 
 
 
200 aa  88.6  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  31.58 
 
 
202 aa  88.6  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  38.69 
 
 
189 aa  88.6  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  30.94 
 
 
200 aa  88.6  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1974  GrpE protein  31.16 
 
 
210 aa  88.2  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.26677  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  35.34 
 
 
239 aa  88.2  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  30.57 
 
 
204 aa  88.6  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  36.23 
 
 
248 aa  88.2  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
200 aa  88.2  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0764  GrpE protein  31.88 
 
 
187 aa  88.2  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  30.13 
 
 
181 aa  87.8  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  29.76 
 
 
247 aa  87.8  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0111  GrpE protein  33.59 
 
 
199 aa  87.8  7e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  36.5 
 
 
211 aa  87.4  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  30.22 
 
 
185 aa  87.4  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  35.34 
 
 
239 aa  87.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  30.82 
 
 
222 aa  87  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  37.69 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  32.06 
 
 
186 aa  86.3  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  32.67 
 
 
208 aa  86.7  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  30.92 
 
 
245 aa  85.9  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  34.48 
 
 
205 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  34.59 
 
 
237 aa  85.9  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>