More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0019 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  100 
 
 		 224 aa  456  1e-127  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  76.89 
 
 		 225 aa  326  1.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  65.07 
 
 		 237 aa  290  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  75.29 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  76.22 
 
 		 259 aa  259  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  66.17 
 
 		 259 aa  258  4e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  57.14 
 
 		 239 aa  249  2e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  59.26 
 
 		 239 aa  249  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  73.38 
 
 		 239 aa  244  9e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00151  heat shock protein GrpE  63.49 
 
 		 239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  51.93 
 
 		 248 aa  180  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  56.69 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  52.5 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  54.6 
 
 		 223 aa  176  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  52.56 
 
 		 246 aa  168  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  44.68 
 
 		 261 aa  157  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  44.68 
 
 		 261 aa  157  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  48.73 
 
 		 286 aa  151  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  36.26 
 
 		 274 aa  122  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  39.64 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  41.91 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  34.76 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  35.71 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  38.24 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  42.31 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  38.04 
 
 		 197 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  37.5 
 
 		 190 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  38.31 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  36.36 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  33.94 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  33.52 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  40 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  32.76 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  32.76 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  34.67 
 
 		 198 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  33.15 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  35.11 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  42.45 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  34 
 
 		 192 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  34 
 
 		 192 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  39.42 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  34.19 
 
 		 172 aa  99  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 188 aa  98.6  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 188 aa  98.6  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 188 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 188 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 188 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 188 aa  98.6  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 188 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 188 aa  98.2  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  33.51 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  37.5 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  26.58 
 
 		 210 aa  97.4  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  34.19 
 
 		 172 aa  97.1  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  33.65 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  35.48 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  33.53 
 
 		 282 aa  97.4  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  39.26 
 
 		 178 aa  96.7  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  31.69 
 
 		 191 aa  95.1  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  32.89 
 
 		 192 aa  95.1  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  38.97 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  33.93 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  34.25 
 
 		 206 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  35.48 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  34.81 
 
 		 206 aa  94  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  35.76 
 
 		 183 aa  92.8  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  34.66 
 
 		 203 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  33.71 
 
 		 206 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  33.71 
 
 		 206 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  33.71 
 
 		 206 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  33.71 
 
 		 206 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  34.09 
 
 		 203 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  32.19 
 
 		 211 aa  91.7  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  33.54 
 
 		 181 aa  91.7  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  34.69 
 
 		 181 aa  91.7  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  34.18 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  35.34 
 
 		 174 aa  91.3  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  33.12 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  36.3 
 
 		 198 aa  90.5  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  36.43 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  33.53 
 
 		 206 aa  90.1  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  32.95 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  31.37 
 
 		 184 aa  89.4  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  31.07 
 
 		 209 aa  88.6  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  31.14 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  32.41 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  33.13 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  31.55 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  32.3 
 
 		 178 aa  87.4  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  33.53 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  33.53 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  32.95 
 
 		 201 aa  86.7  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  31.74 
 
 		 238 aa  86.3  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  37.16 
 
 		 189 aa  85.9  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  34.44 
 
 		 185 aa  85.9  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  35.21 
 
 		 195 aa  85.9  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  32.7 
 
 		 210 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  34.46 
 
 		 199 aa  85.1  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 		 195 aa  85.1  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>