More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2350 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  100 
 
 		 185 aa  380  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1062  GrpE protein  59.48 
 
 		 169 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0506342  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  53.59 
 
 		 180 aa  171  5e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  50.71 
 
 		 201 aa  152  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  46.43 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  35.93 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  36.25 
 
 		 179 aa  100  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  33.33 
 
 		 200 aa  99  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  34.25 
 
 		 259 aa  99  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  34.25 
 
 		 259 aa  98.6  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  38.51 
 
 		 185 aa  98.6  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  35.84 
 
 		 194 aa  98.6  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  36.17 
 
 		 156 aa  97.4  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  38.73 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  37.64 
 
 		 206 aa  95.5  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  34.01 
 
 		 210 aa  95.1  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  37.93 
 
 		 282 aa  95.5  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  32.64 
 
 		 221 aa  95.1  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  40.13 
 
 		 211 aa  94.7  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  29.94 
 
 		 247 aa  94.4  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  33.89 
 
 		 244 aa  94.4  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  34.93 
 
 		 237 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  40.41 
 
 		 175 aa  93.6  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  33.87 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  36.13 
 
 		 243 aa  93.2  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4329  GrpE protein  36.62 
 
 		 242 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.134987  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  34.95 
 
 		 223 aa  92.8  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  34.36 
 
 		 207 aa  92.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  34.06 
 
 		 209 aa  92  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  36.36 
 
 		 197 aa  91.7  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  35.19 
 
 		 226 aa  92  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  37.59 
 
 		 225 aa  91.7  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 208 aa  90.5  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  39.31 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1400  co-chaperone protein GrpE  32.8 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  31.76 
 
 		 239 aa  89  3e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  35.17 
 
 		 213 aa  89.4  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0648  GrpE protein  35 
 
 		 188 aa  89  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  34.48 
 
 		 225 aa  89  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  31.29 
 
 		 239 aa  88.6  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  31.9 
 
 		 245 aa  88.6  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  35.67 
 
 		 204 aa  88.2  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1182  molecular chaperone  32.26 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00339423  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1259  heat shock protein GrpE  38.62 
 
 		 176 aa  87.4  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.481119  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1209  GrpE protein  31.72 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.177941  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  33.87 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  30.2 
 
 		 239 aa  86.3  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0936  heat shock protein GrpE  38.31 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0941203  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  34.44 
 
 		 224 aa  85.9  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  34.97 
 
 		 181 aa  86.3  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  30.99 
 
 		 175 aa  86.3  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  30.56 
 
 		 213 aa  85.5  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  36.3 
 
 		 185 aa  85.5  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  29.75 
 
 		 208 aa  85.5  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  35.81 
 
 		 194 aa  85.5  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4475  GrpE protein  35.06 
 
 		 224 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323495  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  35.29 
 
 		 274 aa  85.5  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1347  GrpE protein  32.14 
 
 		 150 aa  85.1  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.966336  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  37.58 
 
 		 217 aa  85.1  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  36.11 
 
 		 231 aa  85.1  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  34.03 
 
 		 204 aa  84.7  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  35.71 
 
 		 199 aa  84.3  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  30 
 
 		 210 aa  84.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  36.03 
 
 		 198 aa  84.3  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  34.81 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  31.4 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  35 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  33.58 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  28.33 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  32.95 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  31.06 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  38.3 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  28.33 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  28.33 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  28.33 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  36.23 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  28.33 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  34 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  33.13 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  28.33 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  28.33 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  33.12 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  28.33 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  35.51 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2165  GrpE protein  33.09 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.281053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  27.32 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1537  molecular chaperone protein GrpE  34.07 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.818468  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0101  GrpE protein  31.33 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.552759  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  31.91 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  31.18 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  30.59 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  34.29 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  34.97 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  34 
 
 		 222 aa  81.3  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  32.67 
 
 		 248 aa  81.3  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  34.42 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5051  GrpE protein  34.59 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  30.14 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  33.57 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  36.05 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>