More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0095 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  100 
 
 		 282 aa  563  1e-160  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  53.18 
 
 		 243 aa  173  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  51.18 
 
 		 238 aa  171  9e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00660  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  58.33 
 
 		 248 aa  169  7e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.204562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  38.97 
 
 		 213 aa  122  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  45.77 
 
 		 194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  39.24 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 		 198 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  35.35 
 
 		 192 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  45.14 
 
 		 198 aa  112  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  36.18 
 
 		 188 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  36.18 
 
 		 188 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  34.09 
 
 		 192 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  37.27 
 
 		 208 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  41.14 
 
 		 213 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  37.71 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  38.79 
 
 		 210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  35.53 
 
 		 192 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  41.18 
 
 		 189 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  37.5 
 
 		 210 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  35.53 
 
 		 188 aa  109  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  41.5 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  43.07 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  39.19 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  37.84 
 
 		 204 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  44.03 
 
 		 231 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 209 aa  106  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  36.97 
 
 		 210 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  36.13 
 
 		 222 aa  106  5e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.51 
 
 		 217 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  36.68 
 
 		 210 aa  105  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  34.62 
 
 		 191 aa  105  8e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  34.18 
 
 		 210 aa  105  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  38.82 
 
 		 204 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  41.67 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.46 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  39.46 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  37.95 
 
 		 185 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  37.95 
 
 		 185 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  40.14 
 
 		 202 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  35.54 
 
 		 172 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  40.13 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  36.51 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  40.26 
 
 		 180 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  37.97 
 
 		 189 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  41.13 
 
 		 200 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  40 
 
 		 185 aa  103  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  39.35 
 
 		 184 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  35.8 
 
 		 172 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  36.63 
 
 		 206 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  40.13 
 
 		 241 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  36.63 
 
 		 206 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  42.36 
 
 		 212 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  36.63 
 
 		 206 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  36.46 
 
 		 203 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  39.38 
 
 		 186 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  36.63 
 
 		 206 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  36.57 
 
 		 206 aa  103  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  36.46 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  35.79 
 
 		 195 aa  102  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  40.13 
 
 		 196 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  40.13 
 
 		 196 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  40.13 
 
 		 196 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  39.19 
 
 		 179 aa  102  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  36 
 
 		 206 aa  102  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  36.65 
 
 		 209 aa  102  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  41.48 
 
 		 200 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  41.89 
 
 		 187 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  41.48 
 
 		 198 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  31.25 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  35.48 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  35.91 
 
 		 203 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  40.14 
 
 		 189 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  37.82 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  36.05 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  38.32 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  38.89 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  37.87 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  33.73 
 
 		 190 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  33.76 
 
 		 226 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  38.16 
 
 		 196 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  36.59 
 
 		 206 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  34.32 
 
 		 206 aa  99.8  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  37.43 
 
 		 194 aa  99.8  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  39.58 
 
 		 194 aa  99.8  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  38.16 
 
 		 197 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  39.26 
 
 		 186 aa  99.4  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  38.16 
 
 		 197 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  38.16 
 
 		 197 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  38.1 
 
 		 203 aa  99.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  38.16 
 
 		 197 aa  99.8  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  38.16 
 
 		 197 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  34.83 
 
 		 199 aa  99.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  38.16 
 
 		 196 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  31.74 
 
 		 207 aa  99.4  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>