More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1323 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  100 
 
 		 226 aa  449  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  60.13 
 
 		 197 aa  194  8.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  49.21 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  47.75 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  51.3 
 
 		 195 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  46.29 
 
 		 192 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  49.36 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  44.57 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  44.57 
 
 		 188 aa  146  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  44.57 
 
 		 188 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  47.77 
 
 		 192 aa  145  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  44 
 
 		 188 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  44 
 
 		 188 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  44 
 
 		 188 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  44 
 
 		 188 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  44 
 
 		 188 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  48.2 
 
 		 224 aa  141  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  46.5 
 
 		 198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  41.72 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  42.77 
 
 		 192 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  46.26 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  40.7 
 
 		 194 aa  132  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  39.07 
 
 		 225 aa  131  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  43.14 
 
 		 204 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  48.45 
 
 		 208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  47.83 
 
 		 208 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  39.02 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  41.94 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  38.1 
 
 		 223 aa  122  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  39.46 
 
 		 181 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  33.5 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  35.26 
 
 		 239 aa  118  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  39.24 
 
 		 242 aa  118  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  36.41 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  34.43 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  37.8 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  36.41 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  31.58 
 
 		 247 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  33 
 
 		 239 aa  115  5e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1605  GrpE protein  40.26 
 
 		 162 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0303276  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  36.31 
 
 		 207 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  42.19 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  32.47 
 
 		 246 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  31.64 
 
 		 259 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  37.11 
 
 		 225 aa  111  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  37.09 
 
 		 186 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  38.17 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  39.61 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  36.98 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  38.51 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  41.22 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  31.07 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  42.67 
 
 		 217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  32.79 
 
 		 224 aa  108  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  36.72 
 
 		 179 aa  108  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  34.78 
 
 		 200 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  32.12 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  41.38 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  35.95 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  33.33 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  36.31 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  31.25 
 
 		 206 aa  106  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1182  molecular chaperone  39.13 
 
 		 187 aa  106  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00339423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  35.76 
 
 		 286 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  37.04 
 
 		 261 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  38.32 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  37.04 
 
 		 261 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  35.57 
 
 		 187 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1209  GrpE protein  37.27 
 
 		 187 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.177941  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  35.09 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  34.64 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1400  co-chaperone protein GrpE  37.57 
 
 		 187 aa  103  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  31.1 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  35.56 
 
 		 198 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00151  heat shock protein GrpE  34.68 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  39.72 
 
 		 178 aa  101  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  35.81 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  34.32 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  33.33 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  37.82 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0564  GrpE protein  35.9 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  34.15 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1692  GrpE protein  34.39 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.347105  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  35.76 
 
 		 201 aa  99  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  31.84 
 
 		 200 aa  99  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  32.32 
 
 		 217 aa  99  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  33.71 
 
 		 178 aa  99  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1873  GrpE protein  35.22 
 
 		 207 aa  99  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000365995  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0764  GrpE protein  34.76 
 
 		 187 aa  98.2  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  33.01 
 
 		 209 aa  98.2  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  32.68 
 
 		 204 aa  98.2  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  38.15 
 
 		 190 aa  97.8  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0627  co-chaperone protein GrpE  36.04 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0327836  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  32.68 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  37.68 
 
 		 198 aa  96.7  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  30.29 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  34.76 
 
 		 185 aa  95.9  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  34.87 
 
 		 200 aa  95.9  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  32.75 
 
 		 194 aa  95.5  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>