More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0082 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  100 
 
 		 222 aa  431  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  67.16 
 
 		 193 aa  184  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  60.14 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  56.6 
 
 		 267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  62.31 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  58.65 
 
 		 250 aa  162  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0197  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  54.55 
 
 		 264 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135076  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  51.77 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  52.45 
 
 		 212 aa  146  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  51.41 
 
 		 299 aa  144  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  52.94 
 
 		 217 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  48.53 
 
 		 193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  53.28 
 
 		 271 aa  138  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  52.76 
 
 		 298 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  52.48 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  47.01 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  45.45 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0232  GrpE protein  53.28 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.283245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  50.36 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  43.36 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  43.41 
 
 		 188 aa  116  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  42.06 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  47.37 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  40.94 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0350  GrpE protein  42.64 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.851943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  43.07 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  43.07 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  43.07 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  42.21 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  47.06 
 
 		 261 aa  109  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  44.19 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  45.52 
 
 		 199 aa  105  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0441  GrpE protein  39.86 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  40.74 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05500  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  43.09 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18800  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  44.78 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00738423  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  40.4 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5217  GrpE protein  47.97 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3708  GrpE protein  38.67 
 
 		 206 aa  95.9  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.500996 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  32.68 
 
 		 226 aa  96.3  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  37.58 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  34.07 
 
 		 246 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  33.93 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  30.86 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  32.32 
 
 		 225 aa  88.6  7e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  32.72 
 
 		 242 aa  88.2  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  37.14 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  35.17 
 
 		 181 aa  85.1  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  35.06 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  34.62 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  30.46 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  37.21 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  34.84 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  30.46 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  33.08 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  34.31 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  31.1 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  28.75 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0627  co-chaperone protein GrpE  38.51 
 
 		 247 aa  81.6  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0327836  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  34.39 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0674  grpE protein  32.9 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.04297  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  33.71 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  30.81 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  32.91 
 
 		 192 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  32.91 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  35.77 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  31.33 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  32.68 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  32.91 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  29.53 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  32.68 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  32.68 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  31.82 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  32.68 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  32.68 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  32.68 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  30.38 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  32.68 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  32.68 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  37.58 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  31.18 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  31.32 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  31.33 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  31.71 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  33.09 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  29.63 
 
 		 282 aa  78.6  0.00000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  30.49 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  29.48 
 
 		 181 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  30.49 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  33.54 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0309  GrpE protein  31.93 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  32.26 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  32.26 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  31.61 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  32.69 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  35.21 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  31.94 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  32.26 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>